RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 FBLN1P23142 703 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ZAP70P43403 619 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.42□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 MAN1A1P33908 653 aa9.42□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 STIM2Q9P246 746 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 PPP6R2O75170 966 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 PDE6AP16499 860 aa9.42□□□□□ -0.9
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