RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 MYO9BQ13459 2157 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 FAM86C2PA6NEL3 165 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 ERC2O15083 957 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 TLL1O43897 1013 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 GH2P01242 217 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 ACRP10323 421 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 CSF2RAP15509 400 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 GSTO1P78417 241 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 ZNF365Q70YC5 407 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 ACER1Q8TDN7 264 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 XAGE2Q96GT9 111 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 MAML3Q96JK9 1138 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-208ENST00000547298 FLT1P17948 1338 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 PIEZO1Q92508 2521 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 ADAMTS4O75173 837 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 ERCC3P19447 782 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP13.95□□□□□ -0.181e-7■■□□□ 12.1
CS-208ENST00000547298 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 SMCHD1A6NHR9 2005 aa13.95□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 A0A1B0GUL7 405 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 DCDC2CA8MYV0 355 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 RARBP10826 455 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 CDK7P50613 346 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 PPP4CP60510 307 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 RAB30Q15771 203 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 AAK1Q2M2I8 961 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 TATDN1Q6P1N9 297 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 ADGRA1Q86SQ6 560 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 RNF180Q86T96 592 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 SPATA5Q8NB90 893 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 SHCBP1Q8NEM2 672 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 HERVK_113Q902F9 699 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 SPATC1LQ9H0A9 340 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 RAI14Q9P0K7 980 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 MSRAQ9UJ68 235 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 ROBO3Q96MS0 1386 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 MRE11P49959 708 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 ACLYP53396 1101 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 ABRAQ8N0Z2 381 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 KLHDC9Q8NEP7 349 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 FEZ1Q99689 392 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 SLC28A3Q9HAS3 691 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 CD320Q9NPF0 282 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 COPRSQ9NQ92 184 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 STARD7Q9NQZ5 370 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 NRBP1Q9UHY1 535 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 MUC6Q6W4X9 2439 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 PI4K2BG5E9Z4 385 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 MYOGP15173 224 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 GUCY1A2P33402 732 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 USP14P54578 494 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 MICALL1Q8N3F8 863 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 MCAMP43121 646 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 RABGGTBP53611 331 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 TFCP2Q12800 502 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 COG2Q14746 738 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 MVPQ14764 893 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 MTCH2Q9Y6C9 303 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 GBF1Q92538 1859 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 PTPRCP08575 1304 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 ZNF521Q96K83 1311 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 A0A0G2JMZ2 1700 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 MYADML2A6NDP7 307 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 SMIM22K7EJ46 135 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 RFXAPO00287 272 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 RAB3GAP1Q15042 981 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 CCDC174Q6PII3 467 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 TMEM199Q8N511 208 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 VWCEQ96DN2 955 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 TRIM34Q9BYJ4 488 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 IL23AQ9NPF7 189 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 SLC5A4Q9NY91 659 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 FOCADQ5VW36 1801 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 LRRC37A2A6NM11 1700 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-208ENST00000547298 A0A1W2PRG0 241 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-208ENST00000547298 MOXD2PA6NHM9 499 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-208ENST00000547298 KCNA10Q16322 511 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-208ENST00000547298 KRT40Q6A162 431 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-208ENST00000547298 FAM126BQ8IXS8 530 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms