RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-222	ENST00000540445	DPF3	Q92784	378 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	OSBP2	Q969R2	916 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	DEFB118	Q96PH6	123 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445		A0A1W2PRG0	241 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445		H0YGN5	161 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	RAD21	O60216	631 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	HMGCR	P04035	888 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	GNAT2	P19087	354 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	MX1	P20591	662 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	ICA1	Q05084	483 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	TRIM32	Q13049	653 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	LBX2	Q6XYB7	198 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	GPR142	Q7Z601	462 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	TRIB2	Q92519	343 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	FSD1	Q9BTV5	496 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	PORCN	Q9H237	461 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	SH2D4A	Q9H788	454 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	GPAA1	O43292	621 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	TDO2	P48775	406 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	MORN1	Q5T089	497 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	RPTOR	Q8N122	1335 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMO3-222	ENST00000540445	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445		M0R2C6	588 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	FLOT1	O75955	427 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	RGS2	P41220	211 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	PLS1	Q14651	629 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	SBK1	Q52WX2	424 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	LPAR1	Q92633	364 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	VCPKMT	Q9H867	229 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	GOPC	Q9HD26	462 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	BTBD7	Q9P203	1132 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	TMX2	Q9Y320	296 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	KCNA4	P22459	653 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	10.76	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	AAMP	Q13685	434 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	PRO3102	Q9H379	93 aa		10.76	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	SZT2	Q5T011	3432 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	PTPRE	P23469	700 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	DSG3	P32926	999 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	MAP2K5	Q13163	448 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	CCL14	Q16627	93 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	DPP9	Q86TI2	863 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	EVI5L	Q96CN4	794 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	LNPK	Q9C0E8	428 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	NAPB	Q9H115	298 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		10.75	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	STRN	O43815	780 aa		10.74	□□□□□ -0.69
LMO3-222	ENST00000540445	PRDM1	O75626	825 aa		10.74	□□□□□ -0.69

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