RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.58■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.57■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 IFNAR1P17181 557 aa25.57■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 CALM1P0DP23 149 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 CALM2P0DP24 149 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 CALM3P0DP25 149 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 SEPT2Q15019 361 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 FOSBP53539 338 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 DCAF15Q66K64 600 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 DLK2Q6UY11 383 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 AIFM3Q96NN9 605 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 MTMR7Q9Y216 660 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 PASKQ96RG2 1323 aa25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 GH2P01242 217 aa25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP2R5BQ15173 497 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 TTLL1O95922 423 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 GRM4Q14833 912 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 NFKBIBQ15653 356 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 CDKL5O76039 1030 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 PDCP20941 246 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 MAP3K14Q99558 947 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L5A8MUK1 530 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 FKBP1BP68106 108 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA8HP0CJ92 632 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP2B2Q01814 1243 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 GUCY1B3Q02153 619 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 MKL1Q969V6 931 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 NYAP2Q9P242 653 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 F13A1P00488 732 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 CAP2P40123 477 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 PKN1Q16512 942 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 FERMT3Q86UX7 667 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 ALG1Q9BT22 464 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 CPVLQ9H3G5 476 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 CABP5Q9NP86 173 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 FZD1Q9UP38 647 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 STK36Q9NRP7 1315 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A1W2PRG0 241 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 PDHBP11177 359 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 PRKG1Q13976 671 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 CST9Q5W186 159 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 CYTH3O43739 400 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 SNHG28P0DPA3 235 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 KIF5BP33176 963 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 ICA1Q05084 483 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 SHISA4Q96DD7 197 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 MYH4Q9Y623 1939 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.47■■□□□ 1.67
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