RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530238.5

BRMS1-207, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 5

Gene BRMS1, Length 1,817 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-207ENST00000530238 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.42■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 SYT10Q6XYQ8 523 aa26.42■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.42■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 STX10O60499 249 aa26.41■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 IGSF3O75054 1194 aa26.41■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa26.41■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.4■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 ZBTB22O15209 634 aa26.4■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 KCNA3P22001 575 aa26.4■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 BMP6P22004 513 aa26.4■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa26.4■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.827e-6■■□□□ 12.1
BRMS1-207ENST00000530238 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 MAST2Q6P0Q8 1798 aa26.4■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.39■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 SNAP23O00161 211 aa26.39■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 ST5P78524 1137 aa26.39■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 NR5A1Q13285 461 aa26.39■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 CABP5Q9NP86 173 aa26.39■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 LAMB1P07942 1786 aa26.39■■□□□ 1.82
BRMS1-207ENST00000530238 TPM1P09493 284 aa26.39■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 PDE4BQ07343 736 aa26.39■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.39■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 ABCF2Q9UG63 623 aa26.39■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 SLFN14P0C7P3 912 aa26.38■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 CSRNP2Q9H175 543 aa26.38■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.38■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 ORC4O43929 436 aa26.37■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 TGFB2P61812 414 aa26.37■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 FUT2Q10981 343 aa26.37■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.37■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 TRAPPC10P48553 1259 aa26.37■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.37■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 GSDMAQ96QA5 445 aa26.37■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 FOXN1O15353 648 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 ELF2Q15723 593 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 PKN1Q16512 942 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 SPECC1Q5M775 1068 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 ADGRA1Q86SQ6 560 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 TMEM139Q8IV31 216 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 OXER1Q8TDS5 423 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 NLRP3Q96P20 1036 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 CTAGE1Q96RT6 745 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 INTS13Q9NVM9 706 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 DNAI1Q9UI46 699 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 PRR29P0C7W0 189 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.818e-7■■□□□ 12.2
BRMS1-207ENST00000530238 GRIN1Q05586 938 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 REXO1L1PQ8IX06 675 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 TMEM232C9JQI7 657 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 SPATA1Q5VX52 437 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 KRT222Q8N1A0 295 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 COL4A1P02462 1669 aa26.35■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.34■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 TRIM65Q6PJ69 517 aa26.34■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 A0A1B0GTH6 734 aa26.33■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 TROAPQ12815 778 aa26.33■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 PANX2Q96RD6 677 aa26.33■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.33■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 TAF1P21675 1872 aa26.33■■□□□ 1.81
BRMS1-207ENST00000530238 GYG1P46976 350 aa26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 FAM193AP78312 1265 aa26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 NR1I3Q14994 352 aa26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 PDE6BP35913 854 aa26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 TNFRSF25Q93038 417 aa26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 FAM53CQ9NYF3 392 aa26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 H0YIN7 160 aa26.31■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 TTC38Q5R3I4 469 aa26.31■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms