RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 CXCL9Q07325 125 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 STK38Q15208 465 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 JDP2Q8WYK2 163 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 CCDC17Q96LX7 622 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 BCS1LQ9Y276 419 aa26.82■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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ACER3-204ENST00000525861 ME1P48163 572 aa26.8■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 MTMR7Q9Y216 660 aa26.8■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.79■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 SPTLC2O15270 562 aa26.79■■□□□ 1.88
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ACER3-204ENST00000525861 TTLL1O95922 423 aa26.78■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
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ACER3-204ENST00000525861 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
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ACER3-204ENST00000525861 NR5A1Q13285 461 aa26.78■■□□□ 1.88
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ACER3-204ENST00000525861 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.78■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 OXER1Q8TDS5 423 aa26.78■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.78■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 SLURP2P0DP57 97 aa26.77■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 KRT2P35908 639 aa26.77■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 SLC35G1Q2M3R5 365 aa26.77■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 ADALQ6DHV7 355 aa26.77■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.77■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 KLRF2D3W0D1 207 aa26.77■■□□□ 1.88
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ACER3-204ENST00000525861 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.77■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.77■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.77■■□□□ 1.88
ACER3-204ENST00000525861 FAM196BA6NMK8 535 aa26.76■■□□□ 1.87
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ACER3-204ENST00000525861 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.76■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.76■■□□□ 1.87
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ACER3-204ENST00000525861 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.75■■□□□ 1.87
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ACER3-204ENST00000525861 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 PTPAQ15257 358 aa26.75■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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ACER3-204ENST00000525861 USP17L5A8MUK1 530 aa26.74■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.74■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 PPP6R2O75170 966 aa26.74■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 SNHG28P0DPA3 235 aa26.74■■□□□ 1.87
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ACER3-204ENST00000525861 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.74■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 TSPY26PQ9H489 355 aa26.74■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.73■■□□□ 1.87
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ACER3-204ENST00000525861 JMYQ8N9B5 988 aa26.73■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 FAM151AQ8WW52 585 aa26.73■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
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ACER3-204ENST00000525861 NLRP5P59047 1200 aa26.72■■□□□ 1.87
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ACER3-204ENST00000525861 FSIP1Q8NA03 581 aa26.72■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 TNFRSF25Q93038 417 aa26.72■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 CABP5Q9NP86 173 aa26.72■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 CALML3P27482 149 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 RASSF7Q02833 373 aa26.71■■□□□ 1.87
ACER3-204ENST00000525861 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.71■■□□□ 1.87
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