RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-222ENST00000512014 PXYLP1Q8TE99 480 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-222ENST00000512014 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-222ENST00000512014 USP6NLQ92738 828 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-222ENST00000512014 COA7Q96BR5 231 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-222ENST00000512014 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-222ENST00000512014 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-222ENST00000512014 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-222ENST00000512014 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 CCL5P13501 91 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 TDO2P48775 406 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 VPS53Q5VIR6 699 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 FAM227BQ96M60 508 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 OSBPL3Q9H4L5 887 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 VCPKMTQ9H867 229 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 A0A0D9SFI3 127 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 INHAP05111 366 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 TRIM32Q13049 653 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 MORN1Q5T089 497 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 LPAR1Q92633 364 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 UNC93B1Q9H1C4 597 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 PRDM1O75626 825 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 APPP05067 770 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 MAPK4P31152 587 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 GPR142Q7Z601 462 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 PLIN4Q96Q06 1357 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 GJB1P08034 283 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 PDE4AP27815 886 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 DSG3P32926 999 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 GJA8P48165 433 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 UBXN2AP68543 259 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 PPARAQ07869 468 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 COG2Q14746 738 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 TICAM2Q86XR7 235 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 TRIB2Q92519 343 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 RNF208Q9H0X6 261 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 HELLSQ9NRZ9 838 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 MYH4Q9Y623 1939 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 ATP2B2Q01814 1243 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 ATG4CQ96DT6 458 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 NAPBQ9H115 298 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 SH2D4AQ9H788 454 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 INCENPQ9NQS7 918 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 NYAP2Q9P242 653 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 HMGCRP04035 888 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 CYP2B6P20813 491 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 ALX1Q15699 326 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 CCL14Q16627 93 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 CEP95Q96GE4 821 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-222ENST00000512014 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 FLOT1O75955 427 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 IGHA2P01877 340 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 PTPREP23469 700 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 REPS2Q8NFH8 660 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 MKL1Q969V6 931 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 SPATC1LQ9H0A9 340 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF236Q9UL36 1845 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 F5H6K3 240 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 SGPL1O95470 568 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 NDUFB10O96000 172 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 FGAP02671 866 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 FGRP09769 529 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 SDSP20132 328 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-222ENST00000512014 CCNA1P78396 465 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms