RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 SDSP20132 328 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS19P49795 217 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP2B2Q01814 1243 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 TMX2Q9Y320 296 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 FLT3LGP49771 235 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 PRMT2P55345 433 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVK-9P63128 1117 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVK-24P63145 666 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 Q3C1V9 767 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 RAET1EQ8TD07 263 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 PORCNQ9H237 461 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 IL25Q9H293 177 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 VCPKMTQ9H867 229 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 INCENPQ9NQS7 918 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ELNP15502 786 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC22Q5TAA0 569 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 SKAP1Q86WV1 359 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 BTBD7Q9P203 1132 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXD10P28358 340 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 GRK4P32298 578 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 MTFR1Q15390 333 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP95Q96GE4 821 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF3Q9H094 633 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 SH2D4AQ9H788 454 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-218ENST00000511185 LPAR1Q92633 364 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 COA7Q96BR5 231 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ZMYM6O95789 1325 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 RAD21O60216 631 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 FGAP02671 866 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 HAND2P61296 217 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE4BQ07343 736 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 LBX2Q6XYB7 198 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ADCY3O60266 1144 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 FLOT1O75955 427 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ALX1Q15699 326 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TICAM2Q86XR7 235 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ATG4CQ96DT6 458 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 GJD2Q9UKL4 321 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NMT2O60551 498 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPY3P0CV98 308 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPY8P0CW00 308 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 IRF5Q13568 498 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR142Q7Z601 462 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF11Q86T75 865 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 GOPCQ9HD26 462 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NYAP2Q9P242 653 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ALPK3Q96L96 1907 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFB10O96000 172 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 INHAP05111 366 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TFAP4Q01664 338 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 DSG3P32926 999 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM32Q13049 653 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 COG2Q14746 738 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SHISA4Q96DD7 197 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NEDD4P46934 1319 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP2B6P20813 491 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPK4P31152 587 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIB2Q92519 343 aa22.2■■□□□ 1.14
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