RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502470.5

MIB2-215, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-215	ENST00000502470	GJA8	P48165	433 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	TDO2	P48775	406 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	SMC5	Q8IY18	1101 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	LNPK	Q9C0E8	428 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	BTBD7	Q9P203	1132 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	GPR142	Q7Z601	462 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	32.42	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	SH2D4A	Q9H788	454 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	IGHD	P01880	384 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	CYP2B6	P20813	491 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	RASA1	P20936	1047 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	VCPKMT	Q9H867	229 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	ATP2B2	Q01814	1243 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	LPAR1	Q92633	364 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	HMGCR	P04035	888 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	TRIM32	Q13049	653 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	COG2	Q14746	738 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	EVI5L	Q96CN4	794 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MIB2-215	ENST00000502470	CCNA1	P78396	465 aa		32.38	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		32.38	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	TRIB2	Q92519	343 aa		32.38	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	USP6NL	Q92738	828 aa		32.38	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	MORN1	Q5T089	497 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	SGPL1	O95470	568 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	DEFB118	Q96PH6	123 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	PRDM1	O75626	825 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	DSG3	P32926	999 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	FOXP2	O15409	715 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	FLOT1	O75955	427 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	WDR78	Q5VTH9	848 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	32.34	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	NAPB	Q9H115	298 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	RGS2	P41220	211 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	ATG4C	Q96DT6	458 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
MIB2-215	ENST00000502470	CCL14	Q16627	93 aa		32.32	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	GOPC	Q9HD26	462 aa		32.32	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	RPTOR	Q8N122	1335 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	PTPRE	P23469	700 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	NUCB1	Q02818	461 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	PPARA	Q07869	468 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	MAP2K5	Q13163	448 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	RAD21	O60216	631 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	VPS53	Q5VIR6	699 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	FAM227B	Q96M60	508 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	APBA2	Q99767	749 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	NYAP2	Q9P242	653 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	MB21D1	Q8N884	522 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470		A0A0D9SFI3	127 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	GRB14	Q14449	540 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	PDE4B	Q07343	736 aa		32.27	■■■□□ 2.76
MIB2-215	ENST00000502470	CEP95	Q96GE4	821 aa		32.27	■■■□□ 2.76

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