RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479566.5

PRKCZ-216, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-216ENST00000479566 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.37■□□□□ 0.85
PRKCZ-216ENST00000479566 NBPF3Q9H094 633 aa20.37■□□□□ 0.85
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PRKCZ-216ENST00000479566 HAUS7Q99871 368 aa20.36■□□□□ 0.85
PRKCZ-216ENST00000479566 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.36■□□□□ 0.85
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PRKCZ-216ENST00000479566 USP17L21D6R901 530 aa20.29■□□□□ 0.84
PRKCZ-216ENST00000479566 CDK8P49336 464 aa20.29■□□□□ 0.84
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PRKCZ-216ENST00000479566 ATP2B2Q01814 1243 aa20.27■□□□□ 0.84
PRKCZ-216ENST00000479566 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.27■□□□□ 0.84
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PRKCZ-216ENST00000479566 TRPV1Q8NER1 839 aa20.27■□□□□ 0.84
PRKCZ-216ENST00000479566 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.27■□□□□ 0.84
PRKCZ-216ENST00000479566 LRCH3Q96II8 777 aa20.27■□□□□ 0.84
PRKCZ-216ENST00000479566 CCDC17Q96LX7 622 aa20.27■□□□□ 0.84
PRKCZ-216ENST00000479566 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.27■□□□□ 0.84
PRKCZ-216ENST00000479566 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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PRKCZ-216ENST00000479566 CYBAP13498 195 aa20.26■□□□□ 0.83
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PRKCZ-216ENST00000479566 AAMPQ13685 434 aa20.26■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 PLS1Q14651 629 aa20.26■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.26■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 CTR9Q6PD62 1173 aa20.26■□□□□ 0.83
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PRKCZ-216ENST00000479566 MB21D1Q8N884 522 aa20.26■□□□□ 0.83
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PRKCZ-216ENST00000479566 DCTPP1Q9H773 170 aa20.26■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.26■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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PRKCZ-216ENST00000479566 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 CNGA1P29973 690 aa20.25■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.24■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 MSCO60682 206 aa20.24■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 BMP8BP34820 402 aa20.24■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.24■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 DPP9Q86TI2 863 aa20.24■□□□□ 0.83
PRKCZ-216ENST00000479566 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.24■□□□□ 0.83
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