RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476298.2

B9D1-208, Transcript of B9 domain containing 1, human

TSL 3

Gene B9D1, Length 798 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
B9D1-208	ENST00000476298	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	MSC	O60682	206 aa		13.6	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	HOXC6	P09630	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	VCAM1	P19320	739 aa		13.6	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.6	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.6	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298		Q7L0L9	218 aa		13.6	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.6	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	GRB14	Q14449	540 aa		13.59	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.59	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.59	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	LPAR1	Q92633	364 aa		13.59	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	HAUS7	Q99871	368 aa		13.59	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.59	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.59	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.59	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.59	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.59	□□□□□ -0.23
B9D1-208	ENST00000476298	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	CNGA1	P29973	690 aa		13.58	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	SHMT1	P34896	483 aa		13.58	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	PLCD1	P51178	756 aa		13.58	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.58	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.58	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.57	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.57	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	DNM1L	O00429	736 aa		13.57	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	STRN	O43815	780 aa		13.57	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	PDE6A	P16499	860 aa		13.57	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.57	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	COG2	Q14746	738 aa		13.57	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.57	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	IGHA2	P01877	340 aa		13.56	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	GABPA	Q06546	454 aa		13.56	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	SEPT2	Q15019	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.56	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.56	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.56	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.56	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.56	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.56	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	MYH8	P13535	1937 aa		13.56	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.56	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	EYS	Q5T1H1	3165 aa		13.55	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	RLF	Q13129	1914 aa		13.55	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.55	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	CYBA	P13498	195 aa		13.55	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	MX1	P20591	662 aa		13.55	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	CYP2C19	P33261	490 aa		13.55	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.55	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.55	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.55	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.55	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.55	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.55	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298		A0A1W2PRG0	241 aa		13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	ADORA2A	P29274	412 aa		13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	ADD2	P35612	726 aa		13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	TRPV1	Q8NER1	839 aa		13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	MYH7	P12883	1935 aa		13.54	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298		A0A0G2JMZ2	1700 aa		13.53	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	LTBP2	Q14767	1821 aa		13.53	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.53	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	RTP1	P59025	263 aa		13.53	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.53	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.53	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.53	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	MROH8	Q9H579	483 aa		13.53	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.53	□□□□□ -0.24
B9D1-208	ENST00000476298	SEPT4	O43236	478 aa		13.52	□□□□□ -0.25
B9D1-208	ENST00000476298	ERCC3	P19447	782 aa		13.52	□□□□□ -0.25
B9D1-208	ENST00000476298	DSG3	P32926	999 aa		13.52	□□□□□ -0.25
B9D1-208	ENST00000476298	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.52	□□□□□ -0.25
B9D1-208	ENST00000476298	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.52	□□□□□ -0.25
B9D1-208	ENST00000476298	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
B9D1-208	ENST00000476298	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		13.52	□□□□□ -0.25
B9D1-208	ENST00000476298	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		13.51	□□□□□ -0.25
B9D1-208	ENST00000476298	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.51	□□□□□ -0.25
B9D1-208	ENST00000476298	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.51	□□□□□ -0.25
B9D1-208	ENST00000476298	COBL	O75128	1261 aa		13.51	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms