RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB33	Q86T24	672 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	USP33	Q8TEY7	942 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CEP95	Q96GE4	821 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	DESI2	Q9BSY9	194 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	EFCC1	Q9HA90	598 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	OBP2A	Q9NY56	170 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	LCE2B	O14633	110 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GPR182	O15218	404 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CD4	P01730	458 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CYP1A2	P05177	515 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	VCAM1	P19320	739 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GUCY2F	P51841	1108 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	DPYD	Q12882	1025 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PICALM	Q13492	652 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	3.73	□□□□□ -1.81	7e-7	■■■□□ 18.1
TTC3-214	ENST00000472398	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CTR9	Q6PD62	1173 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SRL	Q86TD4	932 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TPH2	Q8IWU9	490 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	RABGGTA	Q92696	567 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CDK15	Q96Q40	435 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398		A0A087X0B3	334 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CCP110	O43303	1012 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	KLHL41	O60662	606 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TMCC2	O75069	709 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	KRT38	O76015	456 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	KRT10	P13645	584 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	KRT20	P35900	424 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CYP4A11	Q02928	519 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	EHHADH	Q08426	723 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	NCOA4	Q13772	614 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ELF2	Q15723	593 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	LINC01559	Q495D7	138 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PACS1	Q6VY07	963 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	RNF180	Q86T96	592 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	GPRASP2	Q96D09	838 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TSGA13	Q96PP4	275 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	NACA2	Q9H009	215 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	MED4	Q9NPJ6	270 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	ATG3	Q9NT62	314 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SERTM1	A2A2V5	107 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398		K7ENM7	598 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	WNT7A	O00755	349 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	MYO1B	O43795	1136 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	SETSIP	P0DME0	302 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	PRPH	P41219	470 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	DGKG	P49619	791 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	KRT83	P78385	493 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	NFKB2	Q00653	900 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM14	Q14142	442 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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