RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
SYNE4-204ENST00000465425 DMTNQ08495 405 aa20.83■□□□□ 0.92
SYNE4-204ENST00000465425 NR1I3Q14994 352 aa20.83■□□□□ 0.92
SYNE4-204ENST00000465425 NPY5RQ15761 445 aa20.83■□□□□ 0.92
SYNE4-204ENST00000465425 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.83■□□□□ 0.92
SYNE4-204ENST00000465425 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
SYNE4-204ENST00000465425 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
SYNE4-204ENST00000465425 SETDB2Q96T68 719 aa20.83■□□□□ 0.92
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SYNE4-204ENST00000465425 MNS1Q8NEH6 495 aa20.82■□□□□ 0.92
SYNE4-204ENST00000465425 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SYNE4-204ENST00000465425 STX17P56962 302 aa20.82■□□□□ 0.92
SYNE4-204ENST00000465425 EVX2Q03828 476 aa20.82■□□□□ 0.92
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SYNE4-204ENST00000465425 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.79■□□□□ 0.92
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SYNE4-204ENST00000465425 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.78■□□□□ 0.92
SYNE4-204ENST00000465425 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
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SYNE4-204ENST00000465425 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.77■□□□□ 0.92
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SYNE4-204ENST00000465425 CCDC175P0C221 793 aa20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 TXLNAP40222 546 aa20.76■□□□□ 0.91
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SYNE4-204ENST00000465425 E2F4Q16254 413 aa20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
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SYNE4-204ENST00000465425 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.76■□□□□ 0.91
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SYNE4-204ENST00000465425 USP17L8P0C7I0 530 aa20.76■□□□□ 0.91
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SYNE4-204ENST00000465425 DESI2Q9BSY9 194 aa20.76■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 CARD6Q9BX69 1037 aa20.76■□□□□ 0.91
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SYNE4-204ENST00000465425 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 BLIDQ8IZY5 108 aa20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 LAMB1P07942 1786 aa20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 GNPATO15228 680 aa20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 TPM1P09493 284 aa20.75■□□□□ 0.91
SYNE4-204ENST00000465425 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
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