RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462012.1

MDM4-208, Transcript of MDM4, p53 regulator, humanhuman

TSL 2

Gene MDM4, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM4-208ENST00000462012 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.01□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 PRDM1O75626 825 aa15□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 CYP2C8P10632 490 aa15□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 VCAM1P19320 739 aa15□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 PRMT2P55345 433 aa15□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 FAM110CQ1W6H9 321 aa15□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 ESR2Q92731 530 aa15□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 COG2Q14746 738 aa14.99□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 CEP95Q96GE4 821 aa14.99□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 KRT23Q9C075 422 aa14.99□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 IL25Q9H293 177 aa14.99□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 HERVK_113P62684 666 aa14.98□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 MB21D1Q8N884 522 aa14.98□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 NBPF3Q9H094 633 aa14.98□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.98□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.98□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 F5H6K3 240 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 HOXD10P28358 340 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 HAND2P61296 217 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 KLRC3Q07444 240 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 IQCA1Q86XH1 822 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 DGKHQ86XP1 1220 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 EFCC1Q9HA90 598 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 TOMM22Q9NS69 142 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 CPA4Q9UI42 421 aa14.97□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 FDX1P10109 184 aa14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 FCGRTP55899 365 aa14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 ATP2B2Q01814 1243 aa14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 PTH1RQ03431 593 aa14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 TRDNQ13061 729 aa14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 ANKS1AQ92625 1134 aa14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 GMCL1Q96IK5 515 aa14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 MTA3Q9BTC8 594 aa14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 LAMA4Q16363 1823 aa14.96□□□□□ -0.01
MDM4-208ENST00000462012 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 PLA2G6O60733 806 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 CYP21A2P08686 494 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 CCNA1P78396 465 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 DGKZQ13574 1117 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 RNF20Q5VTR2 975 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 SKAP1Q86WV1 359 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 TNS4Q8IZW8 715 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 STX8Q9UNK0 236 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.95□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 REC8O95072 547 aa14.94□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 NDUFB10O96000 172 aa14.94□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 DSG3P32926 999 aa14.94□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 PSMC4P43686 418 aa14.94□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 NECTIN1Q15223 517 aa14.94□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.94□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.94□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 INCENPQ9NQS7 918 aa14.94□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 TRIM17Q9Y577 477 aa14.94□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 NEDD4P46934 1319 aa14.93□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 FLOT1O75955 427 aa14.93□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 MAPK4P31152 587 aa14.93□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.93□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 NCOA7Q8NI08 942 aa14.93□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.93□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.93□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 FEM1BQ9UK73 627 aa14.93□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.93□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 KDM4AO75164 1064 aa14.92□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 BMP3P12645 472 aa14.92□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 COPB2P35606 906 aa14.92□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 ERVK-9P63128 1117 aa14.92□□□□□ -0.02
MDM4-208ENST00000462012 ERVK-24P63145 666 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms