RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, human

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UPP1-208	ENST00000436673	COG2	Q14746	738 aa		31.88	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	UBE3C	Q15386	1083 aa		31.88	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		31.88	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	HOXC6	P09630	235 aa		31.87	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		31.87	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		31.87	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		31.87	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	PFAS	O15067	1338 aa		31.86	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	AKR1B1	P15121	316 aa		31.86	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		31.86	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	C12orf60	Q5U649	245 aa		31.86	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		31.86	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	SMIM22	K7EJ46	135 aa		31.85	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		31.85	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	LAMA3	Q16787	3333 aa		31.85	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		31.84	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	USP17L12	C9JPN9	530 aa		31.84	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	USP17L21	D6R901	530 aa		31.84	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	COL6A1	P12109	1028 aa		31.84	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		31.84	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	LPAR1	Q92633	364 aa		31.84	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	CCDC17	Q96LX7	622 aa		31.84	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	TMX2	Q9Y320	296 aa		31.84	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	CDK8	P49336	464 aa		31.83	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	ICA1	Q05084	483 aa		31.83	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		31.83	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	GDF15	Q99988	308 aa		31.83	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		31.83	■■■□□ 2.69
UPP1-208	ENST00000436673	ATP2B2	Q01814	1243 aa		31.82	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		31.82	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		31.82	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		31.82	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		31.82	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		31.82	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		31.82	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	SH2D4A	Q9H788	454 aa		31.81	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	VCPKMT	Q9H867	229 aa		31.81	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	IGHA2	P01877	340 aa		31.8	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	DSG3	P32926	999 aa		31.8	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	BMP8B	P34820	402 aa		31.8	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		31.8	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	MB21D1	Q8N884	522 aa		31.8	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		31.8	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		31.8	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	RLF	Q13129	1914 aa		31.79	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	STRN	O43815	780 aa		31.79	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	CTR9	Q6PD62	1173 aa		31.79	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673		A0A0G2JMZ2	1700 aa		31.78	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	FLOT1	O75955	427 aa		31.78	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	SYN1	P17600	705 aa		31.78	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	ERCC3	P19447	782 aa		31.78	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	ADORA2A	P29274	412 aa		31.78	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	CYP2C19	P33261	490 aa		31.78	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	DPP9	Q86TI2	863 aa		31.77	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	ATG4C	Q96DT6	458 aa		31.77	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	MYH7	P12883	1935 aa		31.77	■■■□□ 2.68
UPP1-208	ENST00000436673	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		31.76	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	MSC	O60682	206 aa		31.76	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	TRPV1	Q8NER1	839 aa		31.76	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	DCTPP1	Q9H773	170 aa		31.76	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	MYH8	P13535	1937 aa		31.76	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		31.75	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	CNGA1	P29973	690 aa		31.75	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		31.75	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		31.75	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	MROH8	Q9H579	483 aa		31.75	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		31.75	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	PLS1	Q14651	629 aa		31.74	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	COBL	O75128	1261 aa		31.73	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	CYBA	P13498	195 aa		31.73	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		31.73	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		31.73	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		31.72	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	LRCH3	Q96II8	777 aa		31.72	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	31.72	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		31.72	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		31.72	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		31.71	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	SBK1	Q52WX2	424 aa		31.71	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	OSBP2	Q969R2	916 aa		31.71	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	GPATCH3	Q96I76	525 aa		31.71	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		31.7	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		31.7	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		31.7	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	APPBP2	Q92624	585 aa		31.7	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		31.7	■■■□□ 2.67
UPP1-208	ENST00000436673	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		31.7	■■■□□ 2.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms