RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMC2O95347 1197 aa28.9■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 BMP15O95972 392 aa28.9■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 UQCRHP07919 91 aa28.9■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARID5BQ14865 1188 aa28.9■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTC38Q5R3I4 469 aa28.9■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.9■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFNKQ9P0W0 207 aa28.9■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 RASA1P20936 1047 aa28.89■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF287Q9HBT7 754 aa28.89■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 STX8Q9UNK0 236 aa28.89■■■□□ 2.22
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRR29P0C7W0 189 aa28.89■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLCG2P16885 1265 aa28.89■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 GRM4Q14833 912 aa28.89■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLF2Q8IX21 1173 aa28.89■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 SP8Q8IXZ3 490 aa28.89■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa28.88■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYL5Q02045 173 aa28.88■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa28.88■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAD2L2Q9UI95 211 aa28.88■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 FLT1P17948 1338 aa28.88■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMC4Q7Z404 712 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 FERMT2Q96AC1 680 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 HSD3B7Q9H2F3 369 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 NEMFO60524 1076 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 BMP6P22004 513 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 RHBDL3P58872 404 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 KANK3Q6NY19 840 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 EPSTI1Q96J88 318 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAN1B1Q9UKM7 699 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 MTMR7Q9Y216 660 aa28.87■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 RIMBP2O15034 1052 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDK8P49336 464 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 GNAQP50148 359 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 GTF2IP78347 998 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 C16orf86Q6ZW13 317 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM47Q9BQJ4 181 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 LTBP1Q14766 1721 aa28.86■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADAMTS3O15072 1205 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 NT5DC1Q5TFE4 455 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMARCE1Q969G3 411 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 GAKO14976 1311 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 FANCCQ00597 558 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 PTGDRQ13258 359 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF827Q17R98 1081 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 DHX58Q96C10 678 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 EYA3Q99504 573 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM205AQ6ZU69 1335 aa28.85■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP1A3P13637 1013 aa28.84■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 CALML3P27482 149 aa28.84■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.84■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 IMPACTQ9P2X3 320 aa28.84■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A087X0B3 334 aa28.84■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRAPPC10P48553 1259 aa28.84■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 SARSP49591 514 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRIMPOLQ96LW4 560 aa28.84■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 BLIDQ8IZY5 108 aa28.83■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 SNED1Q8TER0 1413 aa28.83■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
PLEKHF1-201ENST00000436066 VWA3AA6NCI4 1184 aa28.82■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 GSDMDP57764 484 aa28.82■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMC6Q7Z403 805 aa28.82■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.82■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.82■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 COA1Q9GZY4 146 aa28.82■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 CYTH3O43739 400 aa28.81■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 SRGNP10124 158 aa28.81■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 SKILP12757 684 aa28.81■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 MCM7P33993 719 aa28.81■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC35G1Q2M3R5 365 aa28.81■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.81■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.81■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 MORC3Q14149 939 aa28.81■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.81■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC34Q96HJ3 373 aa28.81■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 GOLGA8HP0CJ92 632 aa28.8■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCZ1BP86790 482 aa28.8■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.8■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIML1Q8N9V2 468 aa28.8■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 FANCLQ9NW38 375 aa28.8■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 SERPINC1P01008 464 aa28.79■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 MLKLQ8NB16 471 aa28.79■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 MYH1P12882 1939 aa28.79■■■□□ 2.2
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLFN14P0C7P3 912 aa28.79■■■□□ 2.2
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