RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371935.6

REXO4-201, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene REXO4, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-201ENST00000371935 PDLIM2Q96JY6 352 aa29.02■■■□□ 2.24
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REXO4-201ENST00000371935 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
REXO4-201ENST00000371935 TOP1P11387 765 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
REXO4-201ENST00000371935 PSMD1Q99460 953 aa29.01■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 SLC35G1Q2M3R5 365 aa29■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 TNFRSF25Q93038 417 aa29■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 HLA-DOAP06340 250 aa29■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 AKR1B1P15121 316 aa29■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 IDI2Q9BXS1 227 aa29■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 EHD4Q9H223 541 aa29■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 BRMS1Q9HCU9 246 aa29■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 CABP5Q9NP86 173 aa29■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 SHMT1P34896 483 aa28.99■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.99■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 PIBF1Q8WXW3 757 aa28.99■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 LZTS2Q9BRK4 669 aa28.99■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 CUTAO60888 179 aa28.98■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 PFKFB1P16118 471 aa28.98■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 SASS6Q6UVJ0 657 aa28.98■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 MTMR4Q9NYA4 1195 aa28.98■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 MTMR7Q9Y216 660 aa28.98■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa28.98■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 COL4A5P29400 1685 aa28.98■■■□□ 2.23
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REXO4-201ENST00000371935 SHC4Q6S5L8 630 aa28.97■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.97■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa28.97■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 CYTH3O43739 400 aa28.97■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 CACNB3P54284 484 aa28.97■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 RASGRP2Q7LDG7 609 aa28.97■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.97■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 NPM3O75607 178 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 CCDC125Q86Z20 511 aa28.96■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 HPSEQ9Y251 543 aa28.96■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 NLRP5P59047 1200 aa28.95■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 ANO6Q4KMQ2 910 aa28.95■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 RESP18Q5W5W9 173 aa28.95■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 FAM200AQ8TCP9 573 aa28.95■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.237e-8■■■■■ 27.6
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REXO4-201ENST00000371935 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
REXO4-201ENST00000371935 GOLGA8HP0CJ92 632 aa28.95■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 SPZ1Q9BXG8 430 aa28.95■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.95■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 KLRF2D3W0D1 207 aa28.94■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 ZNF202O95125 648 aa28.94■■■□□ 2.22
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REXO4-201ENST00000371935 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
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REXO4-201ENST00000371935 CALML3P27482 149 aa28.93■■■□□ 2.22
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REXO4-201ENST00000371935 MYH4Q9Y623 1939 aa28.92■■■□□ 2.22
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REXO4-201ENST00000371935 TRIM75PA6NK02 468 aa28.92■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 ATP2B1P20020 1258 aa28.92■■■□□ 2.22
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REXO4-201ENST00000371935 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28.92■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.92■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 SDF4Q9BRK5 362 aa28.92■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 SMARCA1P28370 1054 aa28.91■■■□□ 2.22
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REXO4-201ENST00000371935 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 TIGD1Q96MW7 591 aa28.91■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 VPS33BQ9H267 617 aa28.91■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 USP17L5A8MUK1 530 aa28.91■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 SYKP43405 635 aa28.91■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 TGFB2P61812 414 aa28.91■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.91■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 CLEC10AQ8IUN9 316 aa28.91■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 USP25Q9UHP3 1055 aa28.91■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 ADAMTS3O15072 1205 aa28.9■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 TTLL1O95922 423 aa28.9■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 SLURP2P0DP57 97 aa28.9■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 PDHBP11177 359 aa28.9■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 SOGA3Q5TF21 947 aa28.9■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 CPVLQ9H3G5 476 aa28.9■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
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REXO4-201ENST00000371935 PI4KBQ9UBF8 816 aa28.9■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 STXBP3O00186 592 aa28.89■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 STX1AQ16623 288 aa28.89■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
REXO4-201ENST00000371935 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
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