RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP2R5EQ16537 467 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXL18Q96ME1 805 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ITIH2P19823 946 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR3DL1P43629 444 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 TNNI3KQ59H18 835 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 NETO1Q8TDF5 533 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 Q96M66 194 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ASPNQ9BXN1 380 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 CEACAM5P06731 702 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 SSTR4P31391 388 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 CD97P48960 835 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF4P78317 190 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 TNK2Q07912 1038 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 MSMPQ1L6U9 139 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 MFSD4AQ8N468 514 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ARMC5Q96C12 935 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 C9IYK1 514 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 PAX4O43316 350 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 DRC1Q96MC2 740 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 KLF4O43474 513 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 RBL2Q08999 1139 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 BBS9Q3SYG4 887 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 GNPTABQ3T906 1256 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 DTX1Q86Y01 620 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 SRFP11831 508 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 SPINK2P20155 84 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 CLCN7P51798 805 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC7A5Q01650 507 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKCQQ04759 706 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 FXNQ16595 210 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 VHLLQ6RSH7 139 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 VAV3Q9UKW4 847 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 WASH4PA8MWX3 477 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BS24 57 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 SHOXO15266 292 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 PRNPP04156 253 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 BNIP3Q12983 259 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-202ENST00000370826 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms