RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356455.8

UBE2C-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2C, Length 850 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-204ENST00000356455 CERS3Q8IU89 383 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 COBLO75128 1261 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 PLS1Q14651 629 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 CLTBP09497 229 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 SEPT2Q15019 361 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
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UBE2C-204ENST00000356455 SHMT1P34896 483 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 ITGB8P26012 769 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 GUCY1A2P33402 732 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 EPHB4P54760 987 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 GRIN2CQ14957 1233 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 MROH8Q9H579 483 aa22.38■■□□□ 1.17
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UBE2C-204ENST00000356455 PHF24Q9UPV7 400 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 TNFRSF10AO00220 468 aa22.37■■□□□ 1.17
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UBE2C-204ENST00000356455 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 RARBP10826 455 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 COL9A1P20849 921 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 PLCD1P51178 756 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 FPGSQ05932 587 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 MB21D1Q8N884 522 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 MAML3Q96JK9 1138 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 RNF180Q86T96 592 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 USP38Q8NB14 1042 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 CDH23Q9H251 3354 aa22.35■■□□□ 1.17
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UBE2C-204ENST00000356455 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 A0A1W2PRG0 241 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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UBE2C-204ENST00000356455 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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UBE2C-204ENST00000356455 KIAA0355O15063 1070 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 FLOT1O75955 427 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 PGK1P00558 417 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 TRIM27P14373 513 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 DSG3P32926 999 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 POLA2Q14181 598 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 TNNQ9UQP3 1299 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 PPM1EQ8WY54 764 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 ATG4CQ96DT6 458 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF576Q9H609 170 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2C-204ENST00000356455 TTC28Q96AY4 2481 aa22.33■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 A0A1W2PQY0 241 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 BCAR3O75815 825 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 TIFAQ96CG3 184 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 MMP19Q99542 508 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 ATP8B2P98198 1209 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 SSH3Q8TE77 659 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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UBE2C-204ENST00000356455 SLC25A27O95847 323 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 PGK2P07205 417 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 GABPAQ06546 454 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 EVX2Q03828 476 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 KCTD2Q14681 263 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
UBE2C-204ENST00000356455 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.29■■□□□ 1.16
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