RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 CLIP2Q9UDT6 1046 aa8.26□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ERLIN2O94905 339 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 FSTL1Q12841 308 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 TNIP1Q15025 636 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 FAM107BQ9H098 131 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 PICK1Q9NRD5 415 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 GGA3Q9NZ52 723 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 USP17L3A6NCW0 530 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 USP17L4A6NCW7 530 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 SRGAP3O43295 1099 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 PYGBP11216 843 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 GCKP35557 465 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 CEP135Q66GS9 1140 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 PHC3Q8NDX5 983 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 C17orf50Q8WW18 174 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 GMLQ99445 158 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 PI16Q6UXB8 463 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 CXorf38Q8TB03 319 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 BICD1Q96G01 975 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ZIC5Q96T25 663 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 A0A1B0GUA9 196 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 CAPN15O75808 1086 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 TIMM10P62072 90 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 TFCP2Q12800 502 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 PRKG1Q13976 671 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 SCARF1Q14162 830 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD2Q9GZV1 360 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 CLRN2A0PK11 232 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 APBB1O00213 710 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 CACNB3P54284 484 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 CCDC181Q5TID7 509 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 SPATA21Q7Z572 469 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.24□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 EYA2O00167 538 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 CDC45O75419 566 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 PDE8BO95263 885 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 OGFOD1Q8N543 542 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ODF2LQ9ULJ1 636 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD65E5RJM6 399 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 H7C1D1 291 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ST18O60284 1047 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 AOC2O75106 756 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 USP17L8P0C7I0 530 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 PHKA1P46020 1223 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 HSP90B2PQ58FF3 399 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 CYP4F22Q6NT55 531 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 COA1Q9GZY4 146 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 TSKSQ9UJT2 592 aa8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 WNT10BO00744 389 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 SLURP2P0DP57 97 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 KRT26Q7Z3Y9 468 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 PODNQ7Z5L7 613 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 DDX11Q96FC9 970 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 MYL1P05976 194 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 FGFR2P21802 821 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 VEGFBP49765 207 aa8.22□□□□□ -1.09
CCR6-202ENST00000349984 IFT88Q13099 833 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.3 ms