RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 GRB14Q14449 540 aa25.46■■□□□ 1.67
SOCS1-201ENST00000332029 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
SOCS1-201ENST00000332029 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 CYP2D6P10635 497 aa25.45■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 ADD2P35612 726 aa25.45■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 ATP2B2Q01814 1243 aa25.45■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.45■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 ARMT1Q9H993 441 aa25.45■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 COG2Q14746 738 aa25.44■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.44■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.44■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.44■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.44■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 SWAP70Q9UH65 585 aa25.44■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.43■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.43■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 MBD4O95243 580 aa25.42■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 DYNLL2Q96FJ2 89 aa25.42■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 PRKAB2O43741 272 aa25.41■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 MSCO60682 206 aa25.41■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 CNGA1P29973 690 aa25.41■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 CYP2C19P33261 490 aa25.41■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.41■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 DCTPP1Q9H773 170 aa25.41■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 UBE3CQ15386 1083 aa25.4■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.4■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 DPP9Q86TI2 863 aa25.4■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 TDHQ8IZJ6 230 aa25.4■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.4■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 CHGBP05060 677 aa25.39■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 AKR1B1P15121 316 aa25.39■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 ADORA2AP29274 412 aa25.39■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 LRIT3Q3SXY7 679 aa25.39■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.39■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.39■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 TRPV1Q8NER1 839 aa25.39■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 LPAR1Q92633 364 aa25.39■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.39■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.39■■□□□ 1.66
SOCS1-201ENST00000332029 STRNO43815 780 aa25.38■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 IGHA2P01877 340 aa25.38■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 ERCC3P19447 782 aa25.38■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 DSG3P32926 999 aa25.38■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 ICA1Q05084 483 aa25.38■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.38■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 GPR153Q6NV75 609 aa25.38■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.38■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 MB21D1Q8N884 522 aa25.38■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 SH2D4AQ9H788 454 aa25.38■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 TMX2Q9Y320 296 aa25.38■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 FLOT1O75955 427 aa25.37■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 CYBAP13498 195 aa25.37■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 OLFML2BQ68BL8 750 aa25.37■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.37■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.37■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.36■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 DNM1LO00429 736 aa25.36■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 PLS1Q14651 629 aa25.36■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 C12orf60Q5U649 245 aa25.36■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC17Q96LX7 622 aa25.36■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 VCPKMTQ9H867 229 aa25.36■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 FRMPD3Q5JV73 1810 aa25.35■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.35■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.35■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 COL6A3P12111 3177 aa25.35■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 SMIM22K7EJ46 135 aa25.35■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 CDK8P49336 464 aa25.35■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 ATG4CQ96DT6 458 aa25.35■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.35■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 GPATCH3Q96I76 525 aa25.35■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 MROH8Q9H579 483 aa25.35■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 DNAH12Q6ZR08 3092 aa25.34■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 USP17L12C9JPN9 530 aa25.34■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 USP17L21D6R901 530 aa25.34■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 COBLO75128 1261 aa25.34■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.34■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.34■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.34■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.34■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.33■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 DEFB123Q8N688 67 aa25.33■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.33■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.33■■□□□ 1.65
SOCS1-201ENST00000332029 MYH7P12883 1935 aa25.32■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 RLFQ13129 1914 aa25.32■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.31■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 Q7L0L9 218 aa25.31■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.31■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.31■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms