RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 ADD2P35612 726 aa30.23■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP2B2Q01814 1243 aa30.23■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 LHX8Q68G74 356 aa30.23■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM179Q6ZVK1 233 aa30.23■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 COG2Q14746 738 aa30.22■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 GDF15Q99988 308 aa30.22■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP5JP18859 108 aa30.21■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 CNGA1P29973 690 aa30.21■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 GRB14Q14449 540 aa30.21■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 CLEC10AQ8IUN9 316 aa30.21■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa30.21■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 HOXC10Q9NYD6 342 aa30.21■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 RLFQ13129 1914 aa30.21■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 A0A0G2JMZ2 1700 aa30.21■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 AMOTL1Q8IY63 956 aa30.2■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 NPLOC4Q8TAT6 608 aa30.2■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 LRCH3Q96II8 777 aa30.2■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 HAUS7Q99871 368 aa30.2■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa30.2■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.2■■■□□ 2.43
PPP4R4-202ENST00000328839 COL6A1P12109 1028 aa30.19■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 AKR1B1P15121 316 aa30.19■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 ICA1Q05084 483 aa30.19■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 DPP9Q86TI2 863 aa30.19■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF236Q9UL36 1845 aa30.18■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa30.18■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 HOXC6P09630 235 aa30.18■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP2C19P33261 490 aa30.18■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 BMP8BP34820 402 aa30.18■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 PLS1Q14651 629 aa30.18■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 SPICE1Q8N0Z3 855 aa30.18■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 DDRGK1Q96HY6 314 aa30.18■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 CHGBP05060 677 aa30.17■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa30.17■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATC1LQ9H0A9 340 aa30.17■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 SH2D4AQ9H788 454 aa30.17■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 PARP14Q460N5 1801 aa30.17■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 FLOT1O75955 427 aa30.16■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRC26Q2I0M4 334 aa30.16■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 LPAR1Q92633 364 aa30.16■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRCC1Q9C099 1032 aa30.16■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L12C9JPN9 530 aa30.15■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L21D6R901 530 aa30.15■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 SMIM22K7EJ46 135 aa30.15■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 ERCC3P19447 782 aa30.15■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 ADORA2AP29274 412 aa30.15■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 CDK8P49336 464 aa30.15■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 C12orf60Q5U649 245 aa30.15■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa30.15■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 MSCO60682 206 aa30.14■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 UBE3CQ15386 1083 aa30.14■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 MB21D1Q8N884 522 aa30.14■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC17Q96LX7 622 aa30.14■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 TMX2Q9Y320 296 aa30.14■■■□□ 2.42
PPP4R4-202ENST00000328839 STRNO43815 780 aa30.13■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 DSG3P32926 999 aa30.13■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 C20orf194Q5TEA3 1177 aa30.13■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa30.13■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 NCAPG2Q86XI2 1143 aa30.13■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 ATG4CQ96DT6 458 aa30.13■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 VCPKMTQ9H867 229 aa30.13■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 LAMA3Q16787 3333 aa30.13■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 C16orf86Q6ZW13 317 aa30.12■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 SIAH1Q8IUQ4 282 aa30.12■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 SHCBP1Q8NEM2 672 aa30.12■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 TRPV1Q8NER1 839 aa30.12■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 RAD21O60216 631 aa30.11■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 TDHQ8IZJ6 230 aa30.11■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 WDR46O15213 610 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 CYBAP13498 195 aa30.1■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 MROH8Q9H579 483 aa30.1■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC5A4Q9NY91 659 aa30.1■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 EEF2P13639 858 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 OLFML2BQ68BL8 750 aa30.09■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 CTR9Q6PD62 1173 aa30.09■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 COBLO75128 1261 aa30.08■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 ANO1Q5XXA6 986 aa30.08■■■□□ 2.41
PPP4R4-202ENST00000328839 DNM1LO00429 736 aa30.07■■■□□ 2.4
PPP4R4-202ENST00000328839 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
PPP4R4-202ENST00000328839 KANSL2Q9H9L4 492 aa30.07■■■□□ 2.4
PPP4R4-202ENST00000328839 ECHDC1Q9NTX5 307 aa30.07■■■□□ 2.4
PPP4R4-202ENST00000328839 DNAH12Q6ZR08 3092 aa30.07■■■□□ 2.4
PPP4R4-202ENST00000328839 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PPP4R4-202ENST00000328839 GOPCQ9HD26 462 aa30.06■■■□□ 2.4
PPP4R4-202ENST00000328839 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PPP4R4-202ENST00000328839 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa30.06■■■□□ 2.4
PPP4R4-202ENST00000328839 IGHA2P01877 340 aa30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 781.3 ms