RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 AKR1B1P15121 316 aa23.64■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 UBE3CQ15386 1083 aa23.64■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 LHX8Q68G74 356 aa23.64■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.64■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.64■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 MYH7P12883 1935 aa23.63■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.63■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PPC1 479 aa23.63■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 SMIM22K7EJ46 135 aa23.63■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 GRB14Q14449 540 aa23.63■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.63■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 C12orf60Q5U649 245 aa23.63■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.63■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.63■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.63■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 PFASO15067 1338 aa23.62■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 USP17L12C9JPN9 530 aa23.62■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 USP17L21D6R901 530 aa23.62■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 HOXC6P09630 235 aa23.62■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 CDK8P49336 464 aa23.62■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.62■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.62■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.62■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.62■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.62■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.62■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 ATP2B2Q01814 1243 aa23.61■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 ICA1Q05084 483 aa23.61■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 LPAR1Q92633 364 aa23.61■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC17Q96LX7 622 aa23.61■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 TMX2Q9Y320 296 aa23.61■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 RLFQ13129 1914 aa23.61■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.6■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 COL6A1P12109 1028 aa23.6■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.6■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.6■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 GDF15Q99988 308 aa23.6■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.6■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 SH2D4AQ9H788 454 aa23.6■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 SYN1P17600 705 aa23.59■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 DSG3P32926 999 aa23.59■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 VCPKMTQ9H867 229 aa23.59■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.59■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.59■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 STRNO43815 780 aa23.58■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 FLOT1O75955 427 aa23.58■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 CNGA1P29973 690 aa23.58■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 CYP2C19P33261 490 aa23.58■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 CTR9Q6PD62 1173 aa23.58■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 DPP9Q86TI2 863 aa23.58■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 MB21D1Q8N884 522 aa23.58■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.58■■□□□ 1.37
CXCL3-201ENST00000296026 ERCC3P19447 782 aa23.57■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 ADORA2AP29274 412 aa23.57■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 BMP8BP34820 402 aa23.57■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 PLS1Q14651 629 aa23.57■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 ATG4CQ96DT6 458 aa23.57■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.56■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 MSCO60682 206 aa23.55■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 IGHA2P01877 340 aa23.55■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.55■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 TRPV1Q8NER1 839 aa23.55■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 MROH8Q9H579 483 aa23.55■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 DCTPP1Q9H773 170 aa23.55■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.55■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 CYBAP13498 195 aa23.54■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.54■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.54■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.54■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 GPATCH3Q96I76 525 aa23.54■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 PARP14Q460N5 1801 aa23.54■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 COBLO75128 1261 aa23.53■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 LRCH3Q96II8 777 aa23.53■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.52■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.52■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 GOPCQ9HD26 462 aa23.52■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.52■■□□□ 1.36
CXCL3-201ENST00000296026 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.51■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 RAD21O60216 631 aa23.51■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.51■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 SBK1Q52WX2 424 aa23.51■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 APPBP2Q92624 585 aa23.51■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 OSBP2Q969R2 916 aa23.51■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.51■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.51■■□□□ 1.35
CXCL3-201ENST00000296026 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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