RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.96□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 HPSEQ9Y251 543 aa9.95□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 KCNJ12Q14500 433 aa9.95□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 PRKAB2O43741 272 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS2O95450 1211 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ATP1A3P13637 1013 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 KIF5AQ12840 1032 aa9.95□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 USP17L21D6R901 530 aa9.94□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 SV2BQ7L1I2 683 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 COPB1P53618 953 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 VPS16Q9H269 839 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 CDC23Q9UJX2 597 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 STX8Q9UNK0 236 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.94□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 AK8Q96MA6 479 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 MAP3K14Q99558 947 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.94□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.94□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 PRDM1O75626 825 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 GYG1P46976 350 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 DNM2P50570 870 aa9.93□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 CCDC42Q96M95 316 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.93□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JLW4 131 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 RFC4P35249 363 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 NR5A1Q13285 461 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 CCDC122Q5T0U0 273 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 KRT79Q5XKE5 535 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 RETREG2Q8NC44 543 aa9.93□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.93□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 ZNF827Q17R98 1081 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 VPS36Q86VN1 386 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 STK24Q9Y6E0 443 aa9.93□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 PDE4DQ08499 809 aa9.92□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 AKR1B10O60218 316 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 LMAN1P49257 510 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 CLCN6P51797 869 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 TFAP4Q01664 338 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 CABP7Q86V35 215 aa9.92□□□□□ -0.82
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