RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233121.6

MAPRE3-201, Transcript of microtubule associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MAPRE3, Length 1,892 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3-201ENST00000233121 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 NPY5RQ15761 445 aa20.94■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 SPECC1Q5M775 1068 aa20.94■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.94■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.94■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 FOCADQ5VW36 1801 aa20.94■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 FAM205CA6NFA0 338 aa20.93■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 GRIN1Q05586 938 aa20.93■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.93■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 PLCD1P51178 756 aa20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 POSTNQ15063 836 aa20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 CSRNP2Q9H175 543 aa20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 RASA1P20936 1047 aa20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 NCAPHQ15003 741 aa20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 TTC38Q5R3I4 469 aa20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 COA1Q9GZY4 146 aa20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.92■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 FLT1P17948 1338 aa20.91■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 USP17L3A6NCW0 530 aa20.91■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 USP17L4A6NCW7 530 aa20.91■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.91■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.91■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.91■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 MYO1BO43795 1136 aa20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 RHBDL3P58872 404 aa20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 ISM2Q6H9L7 571 aa20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 NPR1P16066 1061 aa20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 CDK8P49336 464 aa20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 GSDMDP57764 484 aa20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 MYL5Q02045 173 aa20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 LRMPQ12912 555 aa20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 IMPACTQ9P2X3 320 aa20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.9■□□□□ 0.94
MAPRE3-201ENST00000233121 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 SMARCE1Q969G3 411 aa20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 EYA3Q99504 573 aa20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 DACH1Q9UI36 760 aa20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 STX8Q9UNK0 236 aa20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 SNED1Q8TER0 1413 aa20.89■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 PLSCR1O15162 318 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 SMC2O95347 1197 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 SRGNP10124 158 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 GTF2IP78347 998 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 ZNF174Q15697 407 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 ALDH1B1P30837 517 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 ZNF827Q17R98 1081 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 BLIDQ8IZY5 108 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.939e-9■■■■□ 26.5
MAPRE3-201ENST00000233121 AKT1S1Q96B36 256 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 IFNKQ9P0W0 207 aa20.88■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 FOXN1O15353 648 aa20.87■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 PDE6BP35913 854 aa20.87■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 GALNT17Q6IS24 598 aa20.87■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 PDILTQ8N807 584 aa20.87■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.87■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.87■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.87■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.87■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 CBFA2T2O43439 604 aa20.86■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 PTGDRQ13258 359 aa20.86■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 USP49Q70CQ1 688 aa20.86■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.86■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 MLKLQ8NB16 471 aa20.86■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 MYH8P13535 1937 aa20.86■□□□□ 0.93
MAPRE3-201ENST00000233121 RIMBP2O15034 1052 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms