RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000154553.1

Sft2d1-210, Transcript of Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sft2d1, Length 1,049 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cyp26b1Q811W2 512 aa26.16■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 GlmnQ8BZM1 596 aa26.16■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Nup133Q8R0G9 1155 aa26.16■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Smc1bQ920F6 1248 aa26.16■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pde11aP0C1Q2 933 aa26.15■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Usp53P15975 1069 aa26.15■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 AidaQ8C4Q6 305 aa26.15■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ero1aQ8R180 464 aa26.15■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Eaf2Q91ZD6 262 aa26.15■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa26.15■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Btnl4A2CG29 586 aa26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 MccE9PWI3 1003 aa26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Slc1a4O35874 532 aa26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Slc6a20bO88575 635 aa26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lig1P37913 916 aa26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Nploc4P60670 608 aa26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fam170aQ66LM6 333 aa26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cgnl1Q6AW69 1298 aa26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 BcrQ6PAJ1 1270 aa26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Wbp1lQ8BGW2 348 aa26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ttll1Q91V51 423 aa26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Capn10Q9ESK3 666 aa26.14■■□□□ 1.78
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zmym2Q9CU65 1376 aa26.13■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pnmal2G3X9N3 661 aa26.13■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Hs1bp3Q3TC93 395 aa26.13■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ecm1Q61508 559 aa26.13■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc81Q9D5W4 654 aa26.13■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sh2b2Q9JID9 621 aa26.13■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa26.12■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zkscan2G3X952 960 aa26.12■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pitpnm1O35954 1243 aa26.12■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ptpn12P35831 775 aa26.12■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 GabpaQ00422 454 aa26.12■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pde3bQ61409 1100 aa26.12■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tacc1Q6Y685 774 aa26.12■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dnajc17Q91WT4 303 aa26.12■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pidd1Q9ERV7 915 aa26.12■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zscan18E9PUD6 809 aa26.11■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 FAM186AQ9D9R9 1790 aa26.1■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cspp1B2RX88 1205 aa26.1■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Slc4a3P16283 1227 aa26.1■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mcm2P97310 904 aa26.1■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Q3TYL0 343 aa26.1■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Senp7Q8BUH8 1037 aa26.1■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Clip2Q9Z0H8 1047 aa26.1■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 TicrrQ8BQ33 1889 aa26.09■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ftl1P29391 183 aa26.09■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Stat3P42227 770 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Hmgcs2P54869 508 aa26.09■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tshz1Q5DTH5 1084 aa26.09■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ccdc85aQ5SP85 500 aa26.09■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa26.09■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Htatsf1Q8BGC0 757 aa26.09■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fsd2Q8BZ52 692 aa26.09■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Copb2O55029 905 aa26.08■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 MycP01108 439 aa26.08■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NfiaQ02780 532 aa26.08■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Babam1Q3UI43 333 aa26.08■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cep131Q62036 1060 aa26.08■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fez1Q8K0X8 392 aa26.08■■□□□ 1.77
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ercc3P49135 783 aa26.07■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Col19a1Q0VF58 1136 aa26.07■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Miga1Q4QQM5 600 aa26.07■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 PhkbQ7TSH2 1085 aa26.07■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ms4a5Q810P8 197 aa26.07■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ttc7aQ8BGB2 858 aa26.07■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 DnerQ8JZM4 737 aa26.07■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Arhgef6Q8K4I3 771 aa26.07■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Bst2Q8R2Q8 172 aa26.07■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Nr3c2Q8VII8 978 aa26.07■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mxra8Q9DBV4 442 aa26.07■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Trmt112Q9DCG9 125 aa26.07■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dock5B2RY04 1868 aa26.06■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Skor2A7M7C7 1008 aa26.06■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NeflP08551 543 aa26.06■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tph1P17532 447 aa26.06■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Samd11Q1RNF8 542 aa26.06■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ddx4Q61496 702 aa26.06■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa26.06■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tekt3Q6X6Z7 490 aa26.06■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gprasp2Q8BUY8 826 aa26.06■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 RestQ8VIG1 1082 aa26.06■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tjp3Q9QXY1 905 aa26.06■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cd3dP04235 173 aa26.05■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Traf1P39428 409 aa26.05■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Prune1Q8BIW1 454 aa26.05■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Nek11Q8C0Q4 628 aa26.05■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Morc2bQ8C5W4 1022 aa26.05■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Nmt2O70311 529 aa26.04■■□□□ 1.76
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Alppl2P24823 529 aa26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.1 ms