RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vstm4T1NXB5 319 aa29.74■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbc1d2B1AVH7 922 aa29.74■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep131Q62036 1060 aa29.74■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem60Q8K174 133 aa29.74■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scrn1Q9CZC8 414 aa29.74■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Epb41l3Q9WV92 929 aa29.74■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdha7Q91Y13 937 aa29.73■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mfap3Q922T2 349 aa29.73■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 LpxnQ99N69 386 aa29.73■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Col20a1Q923P0 1320 aa29.73■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm5134E9QAB5 671 aa29.73■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tom1O88746 492 aa29.73■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Txndc5Q91W90 417 aa29.73■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Palm3A2TJV2 734 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 H2afxP27661 143 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 LrmpQ60664 539 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RragbQ6NTA4 374 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rasal3Q8C2K5 1041 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4932429P05RikA2ADI4 785 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mdh1bQ5F204 500 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Itga2bQ9QUM0 1033 aa29.72■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa29.71■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Esyt2Q3TZZ7 845 aa29.71■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myl6bQ8CI43 207 aa29.71■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arid3aQ62431 601 aa29.71■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cfap45Q9D9U9 551 aa29.71■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf609Q8BZ47 1413 aa29.7■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trak2Q6P9N8 913 aa29.7■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdha12Q91Y18 950 aa29.7■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa29.7■■■□□ 2.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa29.7■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ubxn8Q9QZ49 277 aa29.7■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pbx1P41778 430 aa29.69■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc9a1Q61165 820 aa29.69■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa29.69■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trappc10Q3TLI0 1259 aa29.69■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa29.69■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myo19Q5SV80 963 aa29.69■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scgb2b18A0A087WPA9 112 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Actn3O88990 900 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nr5a1P33242 462 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Apol10aQ8CCA5 318 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tada3Q8R0L9 432 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ano3A2AHL1 981 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ess2O70279 479 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slurp2P0DP59 97 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pramel6Q810Y9 485 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pnpla2Q8BJ56 486 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Maats1Q8BRC6 783 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mad2l2Q9D752 211 aa29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NfixP70257 488 aa29.67■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbm12b2Q66JV4 834 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adam6bQ6IMH7 756 aa29.67■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scg2Q03517 617 aa29.67■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Heg1E9Q7X6 1337 aa29.67■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfyve9A2A8R0 1397 aa29.66■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MeiocA2AG06 965 aa29.66■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm3893E9Q1I1 302 aa29.66■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cd2apQ9JLQ0 637 aa29.66■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ecm29Q6PDI5 1840 aa29.66■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kctd3Q8BFX3 815 aa29.66■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ulk4Q3V129 1303 aa29.66■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nfil3O08750 462 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Psmb7P70195 277 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rpusd2Q149F1 553 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ncoa7Q6DFV7 943 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klhl40Q9D783 621 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpina16D3Z660 418 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spg7Q3ULF4 781 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc51Q3URS9 406 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr121Q5CZY0 321 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mfap3lQ9D3X9 409 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AllcQ9JHX6 414 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Uchl5Q9WUP7 329 aa29.65■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Traf1P39428 409 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tlr8P58682 1032 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GypcQ78HU7 95 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zmym2Q9CU65 1376 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Setdb2Q8C267 713 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NelfbQ8C4Y3 580 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam161bQ8CB59 589 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Clip2Q9Z0H8 1047 aa29.64■■■□□ 2.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MthfslL7N466 203 aa29.63■■■□□ 2.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pak1O88643 545 aa29.63■■■□□ 2.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pola2P33611 600 aa29.63■■■□□ 2.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp91Q62511 572 aa29.63■■■□□ 2.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem179Q8BHH9 233 aa29.63■■■□□ 2.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q8CEZ4 452 aa29.63■■■□□ 2.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mcm6P97311 821 aa29.63■■■□□ 2.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf667Q2TL60 609 aa29.63■■■□□ 2.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cnga2Q62398 664 aa29.63■■■□□ 2.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smarca1Q6PGB8 1046 aa29.63■■■□□ 2.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc12Q8R344 166 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 162.4 ms