RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001700.6

Hoxc13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc13, Length 2,461 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 VeztQ3ZK22 780 aa25.02■■□□□ 1.6
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ncaph2Q8BSP2 607 aa25.02■■□□□ 1.6
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Thap2Q9D305 217 aa25.02■■□□□ 1.6
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Nsmce1Q9D720 266 aa25.02■■□□□ 1.6
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Orc1Q9Z1N2 840 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa25.02■■□□□ 1.6
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Slc40a1Q9JHI9 570 aa25.02■■□□□ 1.6
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 ThegQ9JMB1 375 aa25.02■■□□□ 1.6
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Sema4bQ62179 823 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ift122Q6NWV3 1182 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Atp6v0a4Q920R6 833 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gm28042B7ZCM9 1014 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Meis3P97368 378 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Acsbg2Q2XU92 667 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Atad2Q8CDM1 1040 aa25.01■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Wdr19Q3UGF1 1341 aa25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pfkfb3A7UAK5 555 aa25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cplx1P63040 134 aa25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ddx3yQ62095 658 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 NptxrQ99J85 493 aa25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cnksr1A2A9K7 700 aa25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 PnnO35691 725 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 PapolaQ61183 739 aa25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Sugp1Q8CH02 643 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Nup133Q8R0G9 1155 aa25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pus3Q9JI38 481 aa25■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 CebpaP53566 359 aa24.99■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ccdc157Q5SPX1 718 aa24.99■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mea1Q64327 174 aa24.99■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Map10Q8BJS7 891 aa24.99■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gbp9Q8BTS3 619 aa24.99■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 AidaQ8C4Q6 305 aa24.99■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rbm41Q8JZV4 413 aa24.99■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 HibchQ8QZS1 385 aa24.99■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Caap1Q8VDY9 356 aa24.99■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cyp26a1O55127 497 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Grin1P35438 938 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Abcd1P48410 736 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ezh1P70351 747 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Serpinb1cQ5SV42 375 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rhpn1Q61085 643 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Sval3Q76I99 144 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Zic5Q7TQ40 622 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Clec16aQ80U30 1036 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Plcb4Q91UZ1 1175 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Mfap3Q922T2 349 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 UvssaQ9D479 717 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Znf536Q8K083 1302 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Astn2Q80Z10 1352 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 C5P06684 1680 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Sema3fO88632 785 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gfpt1P47856 697 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Olfr121Q5CZY0 321 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 CntrobQ8CB62 887 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dtnbp1Q91WZ8 352 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cacna2d3Q9Z1L5 1091 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Yeats2Q3TUF7 1407 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa24.98■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 RpsaP14206 295 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Dab2P98078 766 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Smarcad1Q04692 1021 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tmem59lQ7TNI2 337 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pank4Q80YV4 820 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kif23E9Q5G3 953 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Trappc3O55013 180 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Abl2Q4JIM5 1182 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Kctd16Q5DTY9 427 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Klhl23Q6GQU2 558 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ccdc172Q810N9 267 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Apol10aQ8CCA5 318 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Spata4Q8K3V1 295 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Smc6Q924W5 1097 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Chmp3Q9CQ10 224 aa24.97■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Speer4aF8VPX6 267 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Nr1i2O54915 431 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 VimP20152 466 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 SsbP32067 415 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Q8C6G1 249 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Q9D9H8 365 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Rab27aQ9ERI2 221 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ube3aO08759 870 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Tmod1P49813 359 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Ccdc50Q810U5 305 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Micall1Q8BGT6 870 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Eva1bQ8K2Y3 164 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Cfap45Q9D9U9 551 aa24.96■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Fbf1A2A870 1173 aa24.95■■□□□ 1.59
Hoxc13-201ENSMUST00000001700 Gnat1P20612 350 aa24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.6 ms