RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C CWP1P28319 239 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C HXT1P32465 570 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C IML3P38265 245 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C DIA4P38705 446 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C RGD2P43556 714 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YFR018CP43599 363 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YGL108CP53139 140 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C CDC14Q00684 551 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C REG1Q00816 1014 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C ARG7Q04728 441 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YDR278CQ05612 105 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C NRT1Q08485 598 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C SUL2Q12325 893 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C NHA1Q99271 985 aa7.02□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C RAD10P06838 210 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C APA1P16550 321 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C PRP9P19736 530 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C CLN1P20437 546 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C PHO84P25297 587 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C RFA2P26754 273 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C SPS19P32573 292 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C SPR1P32603 445 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C PHO11P35842 467 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C TFA2P36145 328 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C PHO12P38693 467 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YAT2P40017 923 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C CTK3P46963 296 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C CSN12P47130 423 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C BRO1P48582 844 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C TIM13P53299 105 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C CSL4P53859 292 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C RSC4Q02206 625 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YDR444WQ04093 687 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C ARP9Q05123 467 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YLR001CQ07895 862 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C PLB3Q08108 686 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YOR389WQ08912 624 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YPL278CQ08990 100 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C TGL5Q12043 749 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YLL056CQ12177 298 aa7.01□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YPR089WO13585 888 aa7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C EPT1P22140 391 aa7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C DCC1P25559 380 aa7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YAL037WP39728 267 aa7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C SAW1P39735 261 aa7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C BIR1P47134 954 aa7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C SIW14P53965 281 aa7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C EGD1Q02642 157 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YDR132CQ03900 495 aa7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C POB3Q04636 552 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C CIA1Q05583 330 aa7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C TRM8Q12009 286 aa7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YDR018CQ12185 396 aa7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa7□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C PLC1P32383 869 aa6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C PIM1P36775 1133 aa6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C DBP8P38719 431 aa6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C TIM17P39515 158 aa6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C SAP4P53036 818 aa6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C KAP114P53067 1004 aa6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C RTS3P53289 263 aa6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YMR160WQ03823 816 aa6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C GSF2Q04697 403 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C MCP2Q06567 569 aa6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YLR149CQ99296 730 aa6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C CYR1P08678 2026 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YLR462WO13556 202 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C RED1P14291 827 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YSP3P25036 478 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C MPE1P35728 441 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C MRPL37P36532 105 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YBR259WP38338 688 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C RCK2P38623 610 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YHL049CP38722 271 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C CYC2P38909 366 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C TES1P41903 349 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YFL064CP43540 174 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C HXT16P47185 567 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YML6P51998 286 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C BTN2P53286 410 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C HXT15P54854 567 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C RLI1Q03195 608 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C SOV1Q04748 898 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YBL111CQ3E7Y5 667 aa6.98□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C RNQ1P25367 405 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C BEM1P29366 551 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C IME2P32581 645 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C SRP101P32916 621 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C CTF13P35203 478 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C GMH1P36125 273 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C LCP5P40079 357 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C ZIM17P42844 174 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C ALR2P43553 858 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C ALY2P47029 1046 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C HLJ1P48353 224 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YGR266WP53326 701 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C YPR003CP53394 754 aa6.97□□□□□ -1.29
SPE3YPR069C FRE4P53746 719 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.7 ms