RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	SNL1	P40548	159 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	UFE1	P41834	346 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	BRE2	P43132	505 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	EAF6	P47128	113 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	YGL117W	P53133	265 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	PRM15	Q03262	622 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	SEG1	Q04279	960 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	CSI1	Q04368	295 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	ARG7	Q04728	441 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	MSH5	Q12175	901 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	PSY3	Q12318	242 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	SKS1	Q12505	502 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PXA1	YPL147W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
PXA1	YPL147W	MET17	P06106	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SEC61	P32915	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	NTH2	P35172	780 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MDJ1	P35191	511 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MRPL17	P36528	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	HXT7	P39004	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	CUL3	P53202	744 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	PLP1	Q04004	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	TCO89	Q08921	799 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	APM4	Q99186	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	ARG3	P05150	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	STE12	P13574	688 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	PEX1	P24004	1043 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MRPL32	P25348	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RTT107	P38850	1070 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SMK1	P41808	388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SSU1	P41930	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	CCC1	P47818	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MON1	P53129	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SOL4	P53315	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SIL1	Q08199	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	HUA2	Q12134	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RMP1	Q12530	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RAD7	P06779	565 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SPT3	P06844	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MSF1	P08425	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	CDC34	P14682	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	ESS1	P22696	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RAD24	P32641	659 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YHR054C	P38780	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	ACO2	P39533	789 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YJR115W	P47152	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YAP6	Q03935	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	GTB1	Q04924	702 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MMR1	Q06324	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	GET4	Q12125	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RTN2	Q12443	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	HSP30	P25619	332 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	DAD2	P36162	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	STS1	P38637	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	QRI7	P43122	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	GNP1	P48813	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	SGF73	P53165	657 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RRN9	P53437	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	PET117	Q02771	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	PDR18	P53756	1333 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	TPK1	P06244	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PXA1	YPL147W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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