RNA–Protein interactions for RNA: YMR085W

YMR085W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YMR085W, Length 1,299 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR085W	YMR085W	TGL1	P34163	548 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YHR033W	P38690	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YEL076C	P39971	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	FMP10	P40098	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	URB2	P47108	1174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	CTR1	P49573	406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YGL082W	P53155	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ADA2	Q02336	434 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	DML1	Q03652	475 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	NSE5	Q03718	556 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MDM36	Q06820	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RAV1	P47104	1357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MSS18	P08593	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	CLB4	P24871	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	KIN82	P25341	720 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RER1	P25560	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ITR1	P30605	584 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MGM1	P32266	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SSO1	P32867	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RSM22	P36056	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RXT2	P38255	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YSW1	P38280	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
YMR085W	YMR085W	ARG2	P40360	574 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	STB1	P42845	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SNZ3	P43545	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	APS3	P47064	194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	TAF4	P50105	388 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MPS2	P53159	387 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SNZ2	P53824	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	IPI3	P53877	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RAD33	Q04231	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	DCS1	Q06151	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YLH47	Q06493	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MCP2	Q06567	569 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SSK2	P53599	1579 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RSR1	P13856	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	TUP1	P16649	713 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SPE2	P21182	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ATP12	P22135	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	POL4	P25615	582 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RIB7	P33312	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YKL063C	P35725	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	PHO11	P35842	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	VPS51	P36116	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SET3	P36124	751 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	GLG1	P36143	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	APM3	P38153	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	PSY4	P38193	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	IFA38	P38286	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	PHO12	P38693	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	MNT3	P40549	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SHE10	P53075	577 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	FHN1	P53279	174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	HST1	P53685	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YNL144C	P53907	740 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	TIM50	Q02776	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	FDC1	Q03034	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YKU80	Q04437	629 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SWA2	Q06677	668 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	OPY2	Q06810	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	AIM41	Q12032	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	HOM3	P10869	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	SEC12	P11655	471 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
YMR085W	YMR085W	PMA2	P19657	947 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YMR085W	YMR085W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.8 ms