RNA–Protein interactions for RNA: YKR055W

RHO4, Transcript of Non-essential small GTPase, yeast

Gene RHO4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RHO4	YKR055W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	STB6	P36085	766 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YBR138C	P38277	524 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SSO2	P39926	295 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	DSE4	P53753	1117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NGL3	Q03210	505 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YDR239C	Q03780	787 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	LAG2	Q92325	660 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	URA3	P03962	267 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	PUT4	P15380	627 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	PRI2	P20457	528 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YCR101C	P25607	182 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	PMT2	P31382	759 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TFC1	P32367	649 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	GRX4	P32642	244 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ORC2	P32833	620 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	PPG1	P32838	368 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NIC96	P34077	839 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TAF14	P35189	244 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	BMT2	P38278	337 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YER184C	P39961	794 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ZIM17	P42844	174 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	CTF18	P49956	741 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YGR117C	P53270	476 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YDR286C	Q05530	114 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ARO10	Q06408	635 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RTT109	Q07794	436 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RSC58	Q07979	502 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MUM3	Q08750	479 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RAX1	Q08760	435 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YPR204W	Q08995	1032 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RCN2	Q12044	265 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ELG1	Q12050	791 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	OSW2	Q12202	724 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	STF1	P01098	86 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	KIN1	P13185	1064 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	OM45	P16547	393 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RIT1	P23796	513 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NAM9	P27929	486 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SEC65	P29478	273 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	KTR2	P33550	425 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	BOL3	P39724	118 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SAW1	P39735	261 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ATG32	P40458	529 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NEO1	P40527	1151 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SAE2	P46946	345 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NNF1	P47149	201 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TAF6	P53040	516 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	DAM1	P53267	343 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YNL115C	P53925	644 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ERG5	P54781	538 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YMR279C	Q03263	540 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NHP10	Q03435	203 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	SSY1	Q03770	852 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	HED1	Q03937	162 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TOS4	Q06266	489 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YPR196W	Q06595	470 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	MHR1	Q06630	226 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ESC8	Q08119	714 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	NTG2	Q08214	380 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	AHC1	Q12433	566 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	ATG11	Q12527	1178 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RHO4	YKR055W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RHO4	YKR055W	ATP4	P05626	244 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RHO4	YKR055W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RHO4	YKR055W	PHO8	P11491	566 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RHO4	YKR055W	CHS2	P14180	963 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RHO4	YKR055W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RHO4	YKR055W	POL3	P15436	1097 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RHO4	YKR055W	PRP28	P23394	588 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RHO4	YKR055W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5

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