RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	SLI15	P38283	698 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	YGR210C	P42942	411 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	FET5	P43561	622 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	NAS6	P50086	228 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	TEP1	P53916	434 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	PET117	Q02771	107 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	RSC9	Q03124	581 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	VTA1	Q06263	330 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	THI20	Q08224	551 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	FEX1	Q08913	375 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	YOR342C	Q12182	319 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	HMG2	P12684	1045 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	ATG22	P25568	528 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	MGT1	P26188	188 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	PMT2	P31382	759 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	AFR1	P33304	620 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	TAF14	P35189	244 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	MSG5	P38590	489 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	LEU5	P38702	357 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	COS5	P47187	383 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	FMP48	P53233	369 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	HDA1	P53973	706 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	YMR187C	Q03236	431 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	DLT1	Q04216	342 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	PIB1	Q06651	286 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	COS7	Q07788	383 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	YEH1	Q07804	573 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	FEX2	Q08991	375 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	CBP3	P21560	335 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	YSP3	P25036	478 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	CWH43	P25618	953 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	ITR1	P30605	584 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	TOD6	P34219	525 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	TSC10	P38342	320 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	SMF2	P38778	549 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	FRT2	P39734	528 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	PZF1	P39933	429 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	YFR018C	P43599	363 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	ROG3	P43602	733 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	RMI1	Q02685	241 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	SPO20	Q04359	397 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	YMR027W	Q04371	470 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	YPR078C	Q06813	372 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	BRE4	Q07660	1125 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RGT1	YKL038W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	HXT2	P23585	541 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	HIR1	P32479	840 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YKL077W	P36081	392 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	CDS1	P38221	457 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YJL070C	P40361	888 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	ELP2	P42935	788 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	GPI8	P49018	411 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	BIO4	P53630	237 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YNL193W	P53870	558 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	EEB1	Q02891	456 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	TDA9	Q04545	1251 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	REH1	Q06709	432 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	RRD2	Q12461	358 aa		5.4	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	GAL1	P04385	528 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	ESS1	P22696	170 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	PDR3	P33200	976 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	RRT2	P38332	387 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	HIS2	P38635	335 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	RIM4	P38741	713 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.39	□□□□□ -1.55	not detected
RGT1	YKL038W	YJR061W	P40355	935 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	CAF16	P43569	289 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	POL31	P46957	487 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YGR125W	P53273	1036 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.39	□□□□□ -1.55	not detected
RGT1	YKL038W	RCN2	Q12044	265 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	PMS1	P14242	873 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	PMA2	P19657	947 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	CCL1	P37366	393 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	YBR225W	P38321	900 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	TGL3	P40308	642 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	EMP47	P43555	445 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	BNA6	P43619	295 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	TOS3	P43637	560 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MAD3	P47074	515 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
RGT1	YKL038W	MUK1	Q02866	612 aa		5.39	□□□□□ -1.55

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