RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W CBS2P14905 389 aa12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W PHO81P17442 1178 aa12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W HRR25P29295 494 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W OTU2P38747 307 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W SER33P40510 469 aa12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W ELP2P42935 788 aa12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W MSE1P48525 536 aa12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W MON1P53129 644 aa12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W SPC105P53148 917 aa12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YNL033WP53964 284 aa12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YNL019CP53975 284 aa12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W MED2Q12124 431 aa12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W UBR2Q07963 1872 aa12.83□□□□□ -0.36
SSA4YER103W MET17P06106 444 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W IDI1P15496 288 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W RVS161P25343 265 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W PAT1P25644 796 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W CLG1P35190 452 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W GRS1P38088 690 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W TOS1P38288 455 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YIL054WP40524 105 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W IMD3P50095 523 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YRR1Q12172 810 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W SEC2P17065 759 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W GID7P25569 745 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YBR242WP38331 238 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W CYC2P38909 366 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YJR061WP40355 935 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W CCT8P47079 568 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W ASN1P49089 572 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W GAL83Q04739 417 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W PEX10Q05568 337 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W NSL1Q12143 216 aa12.82□□□□□ -0.36
SSA4YER103W TPK3P05986 398 aa12.81□□□□□ -0.36
SSA4YER103W HXT3P32466 567 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SSA4YER103W EGD2P38879 174 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SSA4YER103W PSF2P40359 213 aa12.81□□□□□ -0.36
SSA4YER103W FAR7P43592 221 aa12.81□□□□□ -0.36
SSA4YER103W ZAP1P47043 880 aa12.81□□□□□ -0.36
SSA4YER103W ASN2P49090 572 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SSA4YER103W ARE2P53629 642 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SSA4YER103W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SSA4YER103W PUT2P07275 575 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W STF2P16965 84 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W SEC15P22224 910 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W MRP4P32902 394 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W HCS1P34243 683 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W AZR1P50080 613 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W RTT102P53330 157 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YNL010WP53981 241 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W ERO1Q03103 563 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W THP3Q12049 470 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W TPK2P06245 380 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W SKG1P36169 355 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W ERP2P39704 215 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W SOL4P53315 255 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W COG5P53951 403 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YMR155WQ03795 547 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W SYO1Q07395 620 aa12.8□□□□□ -0.36
SSA4YER103W ERR1P0CX10 437 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W ERR2P0CX11 437 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W AMD2P22580 549 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W GDH2P33327 1092 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YBR241CP38142 488 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W PHO88P38264 188 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YHB1P39676 399 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YJL070CP40361 888 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W ERR3P42222 437 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W GLG2P47011 380 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W RAI1P53063 387 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W BUD32P53323 261 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YPR003CP53394 754 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W TLG1Q03322 224 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W AIM39Q08223 395 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W TY3A-GQ12173 290 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W TY3A-IQ99219 290 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W MED11Q99278 115 aa12.79□□□□□ -0.36
SSA4YER103W CDC31P06704 161 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W PBS2P08018 668 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W NFT1P0CE68 1218 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W PUT4P15380 627 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W CRM1P30822 1084 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W RIM1P32445 135 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W THO1P40040 218 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YJL171CP46992 396 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W BNI4P53858 892 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W YNL095CP53932 642 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W ESA1Q08649 445 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W TUB2P02557 457 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W HIS3P06633 220 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W MCM1P11746 286 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W UGA1P17649 471 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W VPS33P20795 691 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W FRE1P32791 686 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W GUA1P38625 525 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W PAC11P40960 533 aa12.78□□□□□ -0.36
SSA4YER103W EFM3P47163 339 aa12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.8 ms