RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617119.4

UBE2V1-223, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 4 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-223	ENST00000617119	CASP14	P31944	242 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PSEN1	P49768	467 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	EPSTI1	Q96J88	318 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		9.99	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ATP2B1	P20020	1258 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	LIFR	P42702	1097 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PHKA1	P46020	1223 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TCIRG1	Q13488	830 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	STRN4	Q9NRL3	753 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	AFM	P43652	599 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	UBE3C	Q15386	1083 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SPATA1	Q5VX52	437 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	GREM2	Q9H772	168 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	FBXO3	Q9UK99	471 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		9.98	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PRKAB2	O43741	272 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	AMPD2	Q01433	879 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	METTL24	Q5JXM2	366 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	HDX	Q7Z353	690 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PAGE5	Q96GU1	130 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	DACH1	Q9UI36	760 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TNS2	Q63HR2	1409 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SMIM22	K7EJ46	135 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF5C	O60282	957 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CASP8	Q14790	479 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ALX1	Q15699	326 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CEP112	Q8N8E3	955 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PPM1E	Q8WY54	764 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CABP5	Q9NP86	173 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	CORO7	P57737	925 aa		9.96	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		9.96	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		9.96	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	STAM	Q92783	540 aa		9.96	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	DRC1	Q96MC2	740 aa		9.96	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARMT1	Q9H993	441 aa		9.96	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		9.96	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		9.96	□□□□□ -0.81
UBE2V1-223	ENST00000617119	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	CTAGE9	A4FU28	777 aa		9.96	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		9.96	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	MBD4	O95243	580 aa		9.96	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	ITGA6	P23229	1130 aa		9.96	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	RTN1	Q16799	776 aa		9.96	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		9.96	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	SNAP23	O00161	211 aa		9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	PHACTR2	O75167	634 aa		9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	KRT31	Q15323	416 aa		9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	LRRC31	Q6UY01	552 aa		9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	DEF6	Q9H4E7	631 aa		9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	TOMM22	Q9NS69	142 aa		9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	TFR2	Q9UP52	801 aa		9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		9.95	□□□□□ -0.82
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms