RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592991.1

LDLRAD4-218, Transcript of low density lipoprotein receptor class A domain containing 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene LDLRAD4, Length 1,640 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LDLRAD4-218	ENST00000592991	DGKH	Q86XP1	1220 aa		29.93	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	SCN4A	P35499	1836 aa		29.92	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	POTEC	B2RU33	542 aa		29.92	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	GJB2	P29033	226 aa		29.92	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	DLK2	Q6UY11	383 aa		29.92	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		29.92	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	WDR90	Q96KV7	1748 aa		29.91	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		29.91	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	ANKS1A	Q92625	1134 aa		29.91	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CCDC17	Q96LX7	622 aa		29.91	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	KAT14	Q9H8E8	782 aa		29.91	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	MTMR7	Q9Y216	660 aa		29.91	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		29.9	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	DDX11	Q96FC9	970 aa		29.9	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		29.9	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	MYH4	Q9Y623	1939 aa		29.9	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	TROAP	Q12815	778 aa		29.89	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	PKP1	Q13835	747 aa		29.89	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		29.89	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		29.89	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	NID2	Q14112	1375 aa		29.89	■■■□□ 2.38
LDLRAD4-218	ENST00000592991	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		29.89	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	TBC1D12	O60347	775 aa		29.89	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	GH2	P01242	217 aa		29.89	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	GUCY1A2	P33402	732 aa		29.89	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	SEPT2	Q15019	361 aa		29.89	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	RTN1	Q16799	776 aa		29.89	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	PNMA1	Q8ND90	353 aa		29.89	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	29.89	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		29.89	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	ADM5	C9JUS6	153 aa		29.88	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	ATP2B2	Q01814	1243 aa		29.88	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	29.88	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	NOV	P48745	357 aa		29.87	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	29.87	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	FZD1	Q9UP38	647 aa		29.87	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		29.87	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CPLX1	O14810	134 aa		29.86	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	DDAH1	O94760	285 aa		29.86	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	MAP3K10	Q02779	954 aa		29.86	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	FANCB	Q8NB91	859 aa		29.86	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		29.86	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		29.86	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		29.86	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		29.86	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		29.85	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		29.85	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	29.85	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	29.85	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		29.85	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	TTLL1	O95922	423 aa		29.85	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	29.85	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	PHKB	Q93100	1093 aa		29.85	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		29.84	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	RCAN1	P53805	252 aa		29.84	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	NTRK3	Q16288	839 aa		29.84	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		29.83	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		29.83	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CABP5	Q9NP86	173 aa		29.83	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		29.83	■■■□□ 2.37
LDLRAD4-218	ENST00000592991	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	FOSB	P53539	338 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	ICA1	Q05084	483 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	SULF1	Q8IWU6	871 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	POTEI	P0CG38	1075 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	POTEJ	P0CG39	1038 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CALM1	P0DP23	149 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CALM2	P0DP24	149 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CALM3	P0DP25	149 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CAP2	P40123	477 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		29.81	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		29.8	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	SYT1	P21579	422 aa		29.79	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	INPP5B	P32019	993 aa		29.79	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	PRKG1	Q13976	671 aa		29.79	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	GRM4	Q14833	912 aa		29.79	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	USP48	Q86UV5	1035 aa		29.79	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	RRAGC	Q9HB90	399 aa		29.79	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
LDLRAD4-218	ENST00000592991	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		29.79	■■■□□ 2.36

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