RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 GRIN3BO60391 1043 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 NOS2P35228 1153 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 DGKZQ13574 1117 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 XKR5Q6UX68 686 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 WHAMMQ8TF30 809 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.73□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 SERPINB2P05120 415 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 PWP1Q13610 501 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 NFIXQ14938 502 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 C8orf34Q49A92 452 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 KCPQ6ZWJ8 1503 aa9.72□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 ITGA6P23229 1130 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 GNAI1P63096 354 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 NGEFQ8N5V2 710 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR152Q8TDT2 470 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 SPON2Q9BUD6 331 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 COL15A1P39059 1388 aa9.71□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A0G2JLW4 131 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 CAMTA2O94983 1202 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ADH1AP07327 375 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF853P0CG23 659 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 DDR1Q08345 913 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 TREML1Q86YW5 311 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.7□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ERVV-1B6SEH8 477 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 USP17L7P0C7H9 530 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 MYL6BP14649 208 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB33AQ14088 237 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 HIF1AQ16665 826 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM55Q9BYV6 548 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 KLK14Q9P0G3 267 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.69□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 CDC14CA4D256 554 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 KLF4O43474 513 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 DPEP1P16444 411 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 PTGIRP43119 386 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 TLR1Q15399 786 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ARSHQ5FYA8 562 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 PSMD1Q99460 953 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 COPRSQ9NQ92 184 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 PIM2Q9P1W9 311 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.68□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 TNFRSF21O75509 655 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 IL2RAP01589 272 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 HOXB7P09629 217 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNA3P22001 575 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 YY1P25490 414 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNMA1Q12791 1236 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 HLFQ16534 295 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR63Q8IWG1 891 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 CNKSR1Q969H4 720 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-216ENST00000590105 MBIPQ9NS73 344 aa9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms