RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587662.1

PTPRH-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRH, Length 571 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-205ENST00000587662 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.42■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa28.42■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 VCAM1P19320 739 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 MAP3K12Q12852 859 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 CERS3Q8IU89 383 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 A0A0C4DFX4 3053 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 PDE6AP16499 860 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 PLEKHH3Q7Z736 793 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 NBPF3Q9H094 633 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 FLRT1Q9NZU1 646 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 BTBD7Q9P203 1132 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa28.4■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 USP17L15C9J2P7 530 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 USP17L11C9JVI0 530 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 USP17L18D6R9N7 530 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 USP17L22D6RA61 530 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 USP17L19D6RCP7 530 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 USP17L20D6RJB6 530 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 COL6A1P12109 1028 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 USP17L24Q0WX57 530 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 RAB3GAP1Q15042 981 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 ABCB5Q2M3G0 1257 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 C7orf61Q8IZ16 206 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
PTPRH-205ENST00000587662 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.39■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 A0A1W2PPC1 479 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 A0A1W2PRG0 241 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 IGHA2P01877 340 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 LBX2Q6XYB7 198 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 TTC6Q86TZ1 520 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 LRCH3Q96II8 777 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 C11orf49Q9H6J7 331 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 APBA2Q99767 749 aa28.37■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 SMIM22K7EJ46 135 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 CYP2D6P10635 497 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 RGS2P41220 211 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 SEPT2Q15019 361 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 FEZ1Q99689 392 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 ZNF532Q9HCE3 1301 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 CHGBP05060 677 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 MAP2K5Q13163 448 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 PDE3AQ14432 1141 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 LCORLQ8N3X6 602 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 SYN1P17600 705 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 BMP8BP34820 402 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 SLC44A5Q8NCS7 719 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 RLFQ13129 1914 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 APBB1O00213 710 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 GOLIM4O00461 696 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 USP14P54578 494 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRH-205ENST00000587662 PTPREP23469 700 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 NPLOC4Q8TAT6 608 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 PRKAB2O43741 272 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 HOXC6P09630 235 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 GRB14Q14449 540 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 LRRC26Q2I0M4 334 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 SLC15A5A6NIM6 579 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 CLEC10AQ8IUN9 316 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 TRPV1Q8NER1 839 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 DYNLL2Q96FJ2 89 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 ARMT1Q9H993 441 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 CABP5Q9NP86 173 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 COG6Q9Y2V7 657 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PTPRH-205ENST00000587662 FRMPD3Q5JV73 1810 aa28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.7 ms