RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		6.74	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		6.74	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	BTBD11	A6QL63	1104 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	SLC24A1	O60721	1099 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGEF15	O94989	841 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	CYBA	P13498	195 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	INPP5B	P32019	993 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	LMNB2	Q03252	620 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	DCAF15	Q66K64	600 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	TESK2	Q96S53	571 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	DNHD1	Q96M86	4753 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	6.72	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	GTF2I	P78347	998 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	6.72	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	FBXW7	Q969H0	707 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	FERMT2	Q96AC1	680 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	SPEF2	Q9C093	1822 aa		6.71	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	COL12A1	Q99715	3063 aa		6.71	□□□□□ -1.33
MSI2-216	ENST00000582772	STXBP3	O00186	592 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	MBTPS2	O43462	519 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	RIPPLY3	P57055	190 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	FAM83A	Q86UY5	434 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	TRPV1	Q8NER1	839 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	HINFP	Q9BQA5	517 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PQY0	241 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	SEPT4	O43236	478 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	HOXC6	P09630	235 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	MAPK4	P31152	587 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	ICAM3	P32942	547 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	IL13	P35225	146 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	CLCN5	P51795	746 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	DCLK2	Q8N568	766 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	SLC9A7	Q96T83	725 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	DOCK2	Q92608	1830 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	AKAP13	Q12802	2813 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGAP6	O43182	974 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	C1QTNF9	P0C862	333 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	CNGA1	P29973	690 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	LTBR	P36941	435 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	ANGPT1	Q15389	498 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	SPATA18	Q8TC71	538 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	KIF12	Q96FN5	646 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	APBB1	O00213	710 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	SLC30A4	O14863	429 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	NCK2	O43639	380 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	PTPN21	Q16825	1174 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	GPR142	Q7Z601	462 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	SPRED2	Q7Z698	418 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	NGEF	Q8N5V2	710 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	VWCE	Q96DN2	955 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34	1e-6	■■■□□ 16.4
MSI2-216	ENST00000582772		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	MAP3K13	O43283	966 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	PFKM	P08237	780 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	PLA2G2A	P14555	144 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	CDK7	P50613	346 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MSI2-216	ENST00000582772	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34

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