RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567228.1

E2F4-209, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 757 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-209ENST00000567228 SEPT2Q15019 361 aa23.36■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.36■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.36■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 USP6NLQ92738 828 aa23.36■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.36■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.36■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.36■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 USP17L15C9J2P7 530 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 USP17L11C9JVI0 530 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 USP17L18D6R9N7 530 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 USP17L22D6RA61 530 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 USP17L19D6RCP7 530 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 USP17L20D6RJB6 530 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 CNMDO75829 334 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 USP14P54578 494 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 ERVK-9P63128 1117 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 ERVK-24P63145 666 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 USP17L24Q0WX57 530 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 LBX2Q6XYB7 198 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.338e-7■□□□□ 9.6
E2F4-209ENST00000567228 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 PORCNQ9H237 461 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 CABP5Q9NP86 173 aa23.35■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 VCAM1P19320 739 aa23.34■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 C12orf60Q5U649 245 aa23.34■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.34■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 CAPN2P17655 700 aa23.33■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 TRIM32Q13049 653 aa23.33■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.33■■□□□ 1.33
E2F4-209ENST00000567228 USP17L12C9JPN9 530 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 USP17L21D6R901 530 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 MAPK4P31152 587 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 MORN1Q5T089 497 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 TRIB2Q92519 343 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 DEFB118Q96PH6 123 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 SWAP70Q9UH65 585 aa23.32■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 PLXNB2O15031 1838 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 CEP290O15078 2479 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 HMGCRP04035 888 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 GCC1Q96CN9 775 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 FEZ1Q99689 392 aa23.31■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 CTR9Q6PD62 1173 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 GPR142Q7Z601 462 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 BTBD7Q9P203 1132 aa23.3■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 H0YGN5 161 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 AKR1B1P15121 316 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 CYP2B6P20813 491 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 CDK8P49336 464 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.323e-7■□□□□ 11.2
E2F4-209ENST00000567228 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 RPTORQ8N122 1335 aa23.29■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 OSBP2Q969R2 916 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.28■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 CCDC17Q96LX7 622 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 TMX2Q9Y320 296 aa23.27■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
E2F4-209ENST00000567228 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.26■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 IGHA2P01877 340 aa23.25■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 COG2Q14746 738 aa23.25■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 SBK1Q52WX2 424 aa23.25■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.25■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 PTPREP23469 700 aa23.24■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 CCL14Q16627 93 aa23.24■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.24■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 APPBP2Q92624 585 aa23.24■■□□□ 1.31
E2F4-209ENST00000567228 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms