RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556718.1

PRPF39-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF39, Length 499 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-210ENST00000556718 MED14OSP0DP75 135 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 RAC2P15153 192 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.23□□□□□ -1.25
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PRPF39-210ENST00000556718 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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PRPF39-210ENST00000556718 SEPT6Q14141 434 aa7.22□□□□□ -1.25
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PRPF39-210ENST00000556718 MYLIPQ8WY64 445 aa7.22□□□□□ -1.25
PRPF39-210ENST00000556718 Q96M66 194 aa7.22□□□□□ -1.25
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PRPF39-210ENST00000556718 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.21□□□□□ -1.26
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PRPF39-210ENST00000556718 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.14□□□□□ -1.27
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PRPF39-210ENST00000556718 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 LMNB1P20700 586 aa7.12□□□□□ -1.27
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PRPF39-210ENST00000556718 ZNF605Q86T29 641 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 EBF1Q9UH73 591 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 GALK1P51570 392 aa7.11□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 DLG4P78352 724 aa7.11□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.11□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.11□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.11□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 GNA15P30679 374 aa7.1□□□□□ -1.27
PRPF39-210ENST00000556718 LILRA2Q8N149 483 aa7.1□□□□□ -1.27
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