RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556474.1

HECTD1-215, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1-215ENST00000556474 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.88■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 CNMDO75829 334 aa21.87■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 GRK4P32298 578 aa21.87■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 C12orf60Q5U649 245 aa21.87■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.87■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.87■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 RLFQ13129 1914 aa21.86■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 USP17L12C9JPN9 530 aa21.86■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 USP17L21D6R901 530 aa21.86■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 ELNP15502 786 aa21.86■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 HERVK_113P62684 666 aa21.86■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.86■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 CTR9Q6PD62 1173 aa21.86■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.86■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.86■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.85■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 AKR1B1P15121 316 aa21.85■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 HOXD10P28358 340 aa21.85■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 RAET1EQ8TD07 263 aa21.85■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.85■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.85■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.85■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 PNMA3Q9UL41 463 aa21.85■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.84■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.84■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 M0R2C6 588 aa21.83■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 CDK8P49336 464 aa21.83■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 IRF5Q13568 498 aa21.83■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.83■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.83■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 PORCNQ9H237 461 aa21.83■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HECTD1-215ENST00000556474 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 ADCY3O60266 1144 aa21.82■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 TRIM32Q13049 653 aa21.82■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.82■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.82■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 FOXP2O15409 715 aa21.81■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 CCL5P13501 91 aa21.81■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 VCAM1P19320 739 aa21.81■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.81■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 USP6NLQ92738 828 aa21.81■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 RNF208Q9H0X6 261 aa21.81■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.81■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.8■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 IGHDP01880 384 aa21.8■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 PXYLP1Q8TE99 480 aa21.8■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 APPBP2Q92624 585 aa21.8■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 BTBD7Q9P203 1132 aa21.8■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 MYH8P13535 1937 aa21.8■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 GJA8P48165 433 aa21.79■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 SLAIN1Q8ND83 568 aa21.79■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 CABP5Q9NP86 173 aa21.79■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 USP17L15C9J2P7 530 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 USP17L11C9JVI0 530 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 USP17L18D6R9N7 530 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 USP17L22D6RA61 530 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 USP17L19D6RCP7 530 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 USP17L20D6RJB6 530 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 INHAP05111 366 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 ERVK-9P63128 1117 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 ERVK-24P63145 666 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 USP17L24Q0WX57 530 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 SBK1Q52WX2 424 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 STAP2Q9UGK3 403 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 SWAP70Q9UH65 585 aa21.78■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 GPAA1O43292 621 aa21.77■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 GJB1P08034 283 aa21.77■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 MX1P20591 662 aa21.77■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 UBXN2AP68543 259 aa21.77■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.77■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 COA7Q96BR5 231 aa21.77■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 LRCH3Q96II8 777 aa21.77■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.77■■□□□ 1.08
HECTD1-215ENST00000556474 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HECTD1-215ENST00000556474 USP14P54578 494 aa21.76■■□□□ 1.07
HECTD1-215ENST00000556474 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.76■■□□□ 1.07
HECTD1-215ENST00000556474 MORN1Q5T089 497 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms