RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551887.2

ITGB7-211, Transcript of integrin subunit beta 7, humanhuman

TSL 4

Gene ITGB7, Length 760 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7-211ENST00000551887 USP33Q8TEY7 942 aa7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 SPATA7Q9P0W8 599 aa7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 MYO1CO00159 1063 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 ZNF24P17028 368 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 ABL2P42684 1182 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 CNGA3Q16281 694 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 TTC30AQ86WT1 665 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 TAF4BQ92750 862 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 JAKMIP2Q96AA8 810 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 FAM212AQ96EL1 285 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 FAM81BQ96LP2 452 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 TTC14Q96N46 770 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 VPS33BQ9H267 617 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.9□□□□□ -1.14
ITGB7-211ENST00000551887 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 ABCC4O15439 1325 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 BBOX1O75936 387 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 CPP00450 1065 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 ANXA1P04083 346 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 TGFB3P10600 412 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 KCTD2Q14681 263 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 WTAPQ15007 396 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 TNIP1Q15025 636 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 PDIA6Q15084 440 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 NFE2L2Q16236 605 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 PTPROQ16827 1216 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 INF2Q27J81 1249 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 PROSER3Q2NL68 480 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 DLK2Q6UY11 383 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 DAAM2Q86T65 1068 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 USP48Q86UV5 1035 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 SP8Q8IXZ3 490 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 FRS2Q8WU20 508 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 RUNDC1Q96C34 613 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 GPATCH3Q96I76 525 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 CDHR1Q96JP9 859 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 PGAP2Q9UHJ9 254 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.88□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 CHL1O00533 1208 aa7.88□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 IVLP07476 585 aa7.88□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 MMEP08473 750 aa7.88□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 COL9A1P20849 921 aa7.88□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
ITGB7-211ENST00000551887 PSMD7P51665 324 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms