RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 FOXQ1Q9C009 403 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 ATP10AO60312 1499 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 SEPT3Q9UH03 358 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 RFXAPO00287 272 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 SYT8Q8NBV8 401 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 MENTQ9BUN1 341 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 POLIQ9UNA4 740 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 PTPRMP28827 1452 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 H3BS24 57 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 ERVK-24P63145 666 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF605Q86T29 641 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 PDZD3Q86UT5 571 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 CEP162Q5TB80 1403 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 MATN3O15232 486 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 PI3P19957 117 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 PLP2Q04941 152 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 CDCA8Q53HL2 280 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 AFAP1Q8N556 730 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 ESR1P03372 595 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 HK2P52789 917 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 FAAP100Q0VG06 881 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 STK32AQ8WU08 396 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 GPR20Q99678 358 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 KDM5CP41229 1560 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 REREQ9P2R6 1566 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 TSPY4P0CV99 314 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 TSPY10P0CW01 314 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 BDH2Q9BUT1 245 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 SLAIN2Q9P270 581 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 AGLP35573 1532 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 TTC16Q8NEE8 873 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 WDR26Q9H7D7 661 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 SRRDQ9UH36 339 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 MAP3K1Q13233 1512 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 RFX1P22670 979 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 MFSD4AQ8N468 514 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 HELQQ8TDG4 1101 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 RICTORQ6R327 1708 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 ADAMTSL3P82987 1691 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 ABCC1P33527 1531 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 MLECQ14165 292 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 RTP5Q14D33 572 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 VMACQ2NL98 169 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 SP8Q8IXZ3 490 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 UBE2FQ969M7 185 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms