RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 NBPF3Q9H094 633 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 CABP5Q9NP86 173 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 GINM1Q9NU53 330 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 RAD50Q92878 1312 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 MYH6P13533 1939 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 A0A1W2PRG0 241 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 USP17L10C9JJH3 530 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ALDH1A1P00352 501 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 BACE1P56817 501 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ICA1Q05084 483 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ALX1Q15699 326 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 TMEM179Q6ZVK1 233 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 CFHR5Q9BXR6 569 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 MKNK2Q9HBH9 465 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ADGRA2Q96PE1 1338 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 PLIN4Q96Q06 1357 aa10.26□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 BRCA2P51587 3418 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 GPR25O00155 361 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 SGSM2O43147 1006 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 CYP2C8P10632 490 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 CAP1Q01518 475 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 PTH1RQ03431 593 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 FAM47AQ5JRC9 791 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 SIAH1Q8IUQ4 282 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 TBC1D10CQ8IV04 446 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 FEZ1Q99689 392 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 DSCC1Q9BVC3 393 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ANAPC4Q9UJX5 808 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 NEDD4P46934 1319 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ATP2B2Q01814 1243 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 PDE4BQ07343 736 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 RUFY2Q8WXA3 655 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 CCDC17Q96LX7 622 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 TMOD4Q9NZQ9 345 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 CPA4Q9UI42 421 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 C19orf81C9J6K1 198 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 NMT2O60551 498 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 TLR2O60603 784 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 TSPY3P0CV98 308 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 TSPY8P0CW00 308 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 EEF2P13639 858 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 VCAM1P19320 739 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 USP17L2Q6R6M4 530 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 CEP95Q96GE4 821 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 C12orf42Q96LP6 360 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 TOMM22Q9NS69 142 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 SMCHD1A6NHR9 2005 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 TSPY2A6NKD2 308 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ZNF213O14771 459 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 PEX10O60683 326 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 FKTNO75072 461 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 FGRP09769 529 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 USP14P54578 494 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 TFAP4Q01664 338 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 AKNAD1Q5T1N1 836 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 C17orf99Q6UX52 265 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 SPICE1Q8N0Z3 855 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 STAG1Q8WVM7 1258 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ZNF287Q9HBT7 754 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 TMX2Q9Y320 296 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 TAF6LQ9Y6J9 622 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 ORC4O43929 436 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 RAD21O60216 631 aa10.21□□□□□ -0.77
CS-211ENST00000548041 CDC45O75419 566 aa10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms