RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-208	ENST00000547541	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	XBP1	P17861	261 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	RXRA	P19793	462 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	KRT85	P78386	507 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	REST	Q13127	1097 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TRIM29	Q14134	588 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ALG1	Q9BT22	464 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TBC1D12	O60347	775 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	NMT2	O60551	498 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SHMT1	P34896	483 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FUT2	Q10981	343 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	GRM4	Q14833	912 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TARBP2-208	ENST00000547541	ELP1	O95163	1332 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	TTLL1	O95922	423 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	MBD3	O95983	291 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	LMNB1	P20700	586 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	TNNI2	P48788	182 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	TCP10	Q12799	353 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	PHKB	Q93100	1093 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	MKL1	Q969V6	931 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CEP95	Q96GE4	821 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	WNT10B	O00744	389 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CACNB3	P54284	484 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	RASSF7	Q02833	373 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	KRT40	Q6A162	431 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	USP48	Q86UV5	1035 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	FERMT3	Q86UX7	667 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	NYAP2	Q9P242	653 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541		H7C1D1	291 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	DTNB	O60941	627 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	AKR1B1	P15121	316 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	PRELP	P51888	382 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	UBE2H	P62256	183 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	GPC2	Q8N158	579 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CSRNP1	Q96S65	589 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	DNAJC18	Q9H819	358 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CABP5	Q9NP86	173 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	MMP1	P03956	469 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	SNHG28	P0DPA3	235 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	PKN1	Q16512	942 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TARBP2-208	ENST00000547541	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	11.67	□□□□□ -0.54

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