RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533872.5

RPS2-215, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 5

Gene RPS2, Length 1,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-215	ENST00000533872	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RPS2-215	ENST00000533872	WBP1L	Q9NX94	342 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RPS2-215	ENST00000533872	USP17L10	C9JJH3	530 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	CYP21A2	P08686	494 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	TSPY3	P0CV98	308 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	TSPY8	P0CW00	308 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	MTMR2	Q13614	643 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	MOGS	Q13724	837 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	PTPN18	Q99952	460 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	NEDD4	P46934	1319 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	C19orf81	C9J6K1	198 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	29.06	■■■□□ 2.24	not detected	■■■■■ 40.4
RPS2-215	ENST00000533872	TFAP4	Q01664	338 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	TOMM22	Q9NS69	142 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	TSPY2	A6NKD2	308 aa		29.05	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		29.05	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		29.05	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		29.05	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		29.05	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		29.05	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	REC8	O95072	547 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	ALDH1A1	P00352	501 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	HMGCS2	P54868	508 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	ACER1	Q8TDN7	264 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	FEZ1	Q99689	392 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	PCNT	O95613	3336 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	BTBD19	C9JJ37	291 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	CA12	O43570	354 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	USP14	P54578	494 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	NECTIN1	Q15223	517 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	ESR2	Q92731	530 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	SH2D4A	Q9H788	454 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		29.03	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872		A0A1W2PRG0	241 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	CEP95	Q96GE4	821 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	C12orf42	Q96LP6	360 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	KRT23	Q9C075	422 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	RNF186	Q9NXI6	227 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	NYAP2	Q9P242	653 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	MYH4	Q9Y623	1939 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RPS2-215	ENST00000533872	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	TMX2	Q9Y320	296 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	SLC27A2	O14975	620 aa		29	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		29	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		29	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		29	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	TTLL1	O95922	423 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	DGKZ	Q13574	1117 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	RNF20	Q5VTR2	975 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872		B4E1Z4	1266 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872		E7EWF7	191 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	TRPA1	O75762	1119 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	ATP2B2	Q01814	1243 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	TRDN	Q13061	729 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	PDHX	O00330	501 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	KDM4A	O75164	1064 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	NOV	P48745	357 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	TREML2	Q5T2D2	321 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	MKL1	Q969V6	931 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	VCPKMT	Q9H867	229 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	NMT2	O60551	498 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	28.96	■■■□□ 2.23	not detected	■■□□□ 11.5
RPS2-215	ENST00000533872	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	LPAR1	Q92633	364 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RPS2-215	ENST00000533872	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
RPS2-215	ENST00000533872	NCOA7	Q8NI08	942 aa		28.95	■■■□□ 2.22
RPS2-215	ENST00000533872	GOPC	Q9HD26	462 aa		28.95	■■■□□ 2.22
RPS2-215	ENST00000533872	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
RPS2-215	ENST00000533872	VCAM1	P19320	739 aa		28.94	■■■□□ 2.22

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