RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510403.5

SPOCK3-214, Transcript of SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3, humanhuman

TSL 4

Gene SPOCK3, Length 563 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3-214ENST00000510403 MAP4K1Q92918 833 aa29.96■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 TMOD4Q9NZQ9 345 aa29.96■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 PHIPQ8WWQ0 1821 aa29.96■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 TSPY3P0CV98 308 aa29.95■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 TSPY8P0CW00 308 aa29.95■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 TFAP4Q01664 338 aa29.95■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 GADL1Q6ZQY3 521 aa29.95■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 STAG1Q8WVM7 1258 aa29.95■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 FEZ1Q99689 392 aa29.95■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa29.95■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 TOMM22Q9NS69 142 aa29.95■■■□□ 2.39
SPOCK3-214ENST00000510403 BTBD19C9JJ37 291 aa29.94■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 NT5C2P49902 561 aa29.94■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 USP14P54578 494 aa29.94■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 ICA1Q05084 483 aa29.94■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 MTMR2Q13614 643 aa29.94■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 MOGSQ13724 837 aa29.94■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 USP17L2Q6R6M4 530 aa29.94■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 INCENPQ9NQS7 918 aa29.94■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 HMGCS2P54868 508 aa29.93■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.93■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.93■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.93■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 SH2D4AQ9H788 454 aa29.93■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.93■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 TSPY2A6NKD2 308 aa29.92■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa29.92■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 ACER1Q8TDN7 264 aa29.92■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 CFHR5Q9BXR6 569 aa29.92■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.91■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 GPAT2Q6NUI2 795 aa29.91■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.91■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 NBPF3Q9H094 633 aa29.91■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa29.91■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 PDHXO00330 501 aa29.9■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 FOXN1O15353 648 aa29.9■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa29.9■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa29.9■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 TMX2Q9Y320 296 aa29.9■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.9■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 EEF2P13639 858 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 ATP2B2Q01814 1243 aa29.89■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 SIAH1Q8IUQ4 282 aa29.89■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 NYAP2Q9P242 653 aa29.89■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.89■■■□□ 2.38
SPOCK3-214ENST00000510403 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29.88■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 TBC1D8O95759 1140 aa29.88■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 ESR2Q92731 530 aa29.88■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 C12orf42Q96LP6 360 aa29.88■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 CNNM2Q9H8M5 875 aa29.88■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.88■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.88■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 A0A1W2PRG0 241 aa29.87■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 KRT23Q9C075 422 aa29.87■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 MTMR4Q9NYA4 1195 aa29.87■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 TTLL1O95922 423 aa29.86■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 CYP21A2P08686 494 aa29.86■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 OSBPP22059 807 aa29.86■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.86■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 CEP95Q96GE4 821 aa29.86■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 CLIP2Q9UDT6 1046 aa29.86■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 PNMA3Q9UL41 463 aa29.86■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 PCNTO95613 3336 aa29.86■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 REC8O95072 547 aa29.85■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 TRDNQ13061 729 aa29.85■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 CRHR2Q13324 411 aa29.85■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 TREML2Q5T2D2 321 aa29.85■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 MKL1Q969V6 931 aa29.85■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa29.85■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 TSKSQ9UJT2 592 aa29.85■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 PTPRFP10586 1907 aa29.84■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 DGKZQ13574 1117 aa29.84■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 LPAR1Q92633 364 aa29.84■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 GOPCQ9HD26 462 aa29.84■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa29.84■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 LAMA4Q16363 1823 aa29.84■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 NECTIN1Q15223 517 aa29.83■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 RNF20Q5VTR2 975 aa29.83■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 VCPKMTQ9H867 229 aa29.83■■■□□ 2.37
SPOCK3-214ENST00000510403 NEDD4P46934 1319 aa29.82■■■□□ 2.36
SPOCK3-214ENST00000510403 CCDC178Q5BJE1 867 aa29.82■■■□□ 2.36
SPOCK3-214ENST00000510403 IL17RBQ9NRM6 502 aa29.82■■■□□ 2.36
SPOCK3-214ENST00000510403 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
SPOCK3-214ENST00000510403 USP17L15C9J2P7 530 aa29.81■■■□□ 2.36
SPOCK3-214ENST00000510403 USP17L13C9JLJ4 530 aa29.81■■■□□ 2.36
SPOCK3-214ENST00000510403 USP17L11C9JVI0 530 aa29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms