RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 POTEIP0CG38 1075 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CDC25BP30305 580 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 BPIFB4P59827 614 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 MXRA7P84157 204 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 SEPT2Q15019 361 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC174Q6PII3 467 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC43Q8N309 656 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CDHR1Q96JP9 859 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 C2CD2Q9Y426 696 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 ABCC8Q09428 1581 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 UACAQ9BZF9 1416 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 A6NNZ2 444 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 POTEB2H3BUK9 544 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 DIAPH2O60879 1101 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC153Q494R4 210 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 KRT77Q7Z794 578 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 FAM228AQ86W67 206 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 RELL1Q8IUW5 271 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 GIPC2Q8TF65 315 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CGREF1Q99674 301 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 ATP10AO60312 1499 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 POTEFA5A3E0 1075 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 STXBP3O00186 592 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 SUPT3HO75486 399 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 HALP42357 657 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 MYO1EQ12965 1108 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 KCTD2Q14681 263 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 ASB3Q9Y575 518 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 SQORQ9Y6N5 450 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 BIN1O00499 593 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 TEX28O15482 410 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CYTH3O43739 400 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CLTAP09496 248 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 GSTM4Q03013 218 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 DAAM2Q86T65 1068 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 LILRB2Q8N423 598 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 NDNQ99608 321 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CHL1O00533 1208 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 LDHCP07864 332 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 S100A1P23297 94 aa6.88□□□□□ -1.31
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PDE4D-216ENST00000507116 ZNF75DP51815 510 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 SESTD1Q86VW0 696 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 DRC3Q9H069 523 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 SLAIN2Q9P270 581 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 STK39Q9UEW8 545 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 SHROOM2Q13796 1616 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 BIRC5O15392 142 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-216ENST00000507116 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.317e-8■■■■□ 24.8
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