RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492897.3

HOXB-AS3-214, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ARMT1Q9H993 441 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MYH1P12882 1939 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP17L15C9J2P7 530 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP17L11C9JVI0 530 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP17L18D6R9N7 530 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP17L22D6RA61 530 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP17L17D6RBQ6 530 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP17L19D6RCP7 530 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP17L20D6RJB6 530 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRKAB2O43741 272 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HMGCRP04035 888 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CYP2D6P10635 497 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 VCAM1P19320 739 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP14P54578 494 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ERVK-9P63128 1117 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ERVK-24P63145 666 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP17L24Q0WX57 530 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SIAH1Q8IUQ4 282 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 A0A1W2PRG0 241 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 H0YGN5 161 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MAPK4P31152 587 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SEPT2Q15019 361 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MORN1Q5T089 497 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DEFB118Q96PH6 123 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PORCNQ9H237 461 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CABP5Q9NP86 173 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MBD4O95243 580 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRIM32Q13049 653 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRIB2Q92519 343 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RPTORQ8N122 1335 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PLXNB2O15031 1838 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SMIM22K7EJ46 135 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C12orf60Q5U649 245 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GPR142Q7Z601 462 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLC44A5Q8NCS7 719 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SWAP70Q9UH65 585 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SZT2Q5T011 3432 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGHA2P01877 340 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DYNLL2Q96FJ2 89 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FEZ1Q99689 392 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NUDT12Q9BQG2 462 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TFRCP02786 760 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMEM179Q6ZVK1 233 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HTATIP2Q9BUP3 242 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRO3102Q9H379 93 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BTBD7Q9P203 1132 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP17L12C9JPN9 530 aa18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 USP17L21D6R901 530 aa18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CYP2B6P20813 491 aa18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C16orf86Q6ZW13 317 aa18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ANKLE1Q8NAG6 615 aa18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PAGR1Q9BTK6 254 aa18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PCDH10Q9P2E7 1040 aa18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OGDHLQ9ULD0 1010 aa18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa18■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NAV1Q8NEY1 1877 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AKR1B1P15121 316 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CDK8P49336 464 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CTR9Q6PD62 1173 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KBTBD3Q8NAB2 608 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DPF3Q92784 378 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CCDC17Q96LX7 622 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BCL11AQ9H165 835 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMX2Q9Y320 296 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LAMA3Q16787 3333 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HOXC6P09630 235 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RGS2P41220 211 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 COG2Q14746 738 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CCL14Q16627 93 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.3 ms